在文官學院的訓練課程中，「問題分析與解決」單元強調培養生手變成專家，方法就是閱讀、討論與寫作。閱讀讓思考更廣博、討論讓思考更敏銳、寫作讓思考更周延，這也是大學教育、研究所要求學生撰寫畢業專題、學位論文的目的之一。
然而論文寫作真的很容易讓人頭疼，除了找題目、做研究、掌握研究方法之外，從發想構思到下筆書寫，許多正在寫學術論文的學生都會發現，儘管中文天天使用，作文從小寫到大，卻越寫越不清楚。許多學生辛辛苦苦寫了一大堆，卻被指導教授刪除一大半，並要求再補充一些數據，或是論文的邏輯結構連自己都說不清楚。
實踐大學李慶芳教授指出，要從事研究工作，學習者必須先建構自己的知識體系，它就像是一個書櫃，在我們的腦中建立一個有結構的圖形概念，並以思維導圖建構研究的脈絡架構。往後不論是閱讀文獻或者與人交談，即可將吸收的知識置入自己的思維導圖知識體系。
第1節 構思研究架構
本體論、實踐論、知識論與方法論，在論文的研究思考與寫作過程中是息息相關且環環相扣。用「思維導圖」思索建構研究的本體關懷、具體實踐、知識基礎與背景脈絡，是一種很好的選擇。思維導圖法的圖像式思考強化主題印象，也容易由直覺而產生更多寫作的靈感。首先將論文核心的概念擺在中央作為思考的起點，並在外圍列出與核心相關的問題，這樣可以使研究者清楚研究主題思考的範圍，進而從核心張開觸手，延伸到其他領域。運用思維導圖法，以一個知識點為基礎，逐步運用連結的方式，增加寫作思考的深度與廣度。
從本體關懷、具體實踐、知識基礎與背景脈絡作為構思論文的起點
從上面的思維導圖中，研究者很清楚地從一個頁面中掌握了「本體關懷」、「知識理論」及「方法運用」的相關論述。每一個支幹上的概念都可以再度發展出一個新的思維導圖，以它為中心擴展出更多、更有創意且有結構的想法。例如，從「本體關懷」中的「研究對像」的「界定」，發展出右面上圖，兩者之間做出雙向超鏈接，點選「界定」這個支幹的「C」符號，可鏈接到「研究對像界定」這張思維導圖的中心主題；點選中心主題的「T」符號又可超鏈接回到「界定」這個支幹。
界定研究對像
從220頁的思維導圖，逐步以類似上圖的方式，發展完成「本體關懷」、「具體實踐」、「知識基礎」與「背景脈絡」所有必須考慮的內容，接下來就可清晰梳理研究的概念與脈絡，發展出論文章節架構的思維導圖。
從上頁思維導圖中的「背景脈絡」——「響應」——「現況、問題與困難」超鏈接到下圖的主幹「研究」；上頁圖中「已有」的「知識」則超鏈接到圖下的主幹「文獻探討」；上頁圖中「Do something in order to…」則超鏈接到下圖的支幹「研究」和「目的」。以此類推，逐步將論文各個章節內容建構起來，特別是提出研究計劃時，必須完成的第一、二、三章。
論文章結構的思維導圖
第2節 文獻資料的整理
論文寫作時應用思維導圖法整理文獻數據，技巧與第十二章第四節提到的「主題式的數據搜集整理筆記技巧」相似。我們先根據研究主題衍生出來的動機與目的去探討相關知識，來支持研究的進行與發展。
舉例來說，思維導圖的中心主題是論文的「第二章文獻探討」；主幹則是第二章所要探討的各個主題，也就是這章當中的各「節」；主幹之後的第一階支幹是各節的次主題或標題；接著再根據次主題或標題去閱讀相關文獻，並把有意義、有價值的重點內容，整理到思維導圖相關的支幹下。
論文第二章「文獻探討」架構
加入次主題或標題的思維導圖架構
以思維導圖先把「文獻探討」的基本結構與內容重點，以關鍵詞方式整理出來，可以讓研究者或指導教授清楚地看出思路是否清晰，邏輯結構是否合理、順暢，內容是否完整。若有必要增補或刪減內容，也會很容易。若有已知的文獻出處，可在支幹備註欄上先行加注。架構清楚了，接著再以整理文章筆記的思維導圖技巧，以關鍵詞的方式有系統、有結構地探討，整理出不同學者的意見。最後依據思維導圖的樹狀結構，書寫成文書格式，每個小主題書寫完畢後，再從該小樹狀結構是探討了哪些學者的文獻，按照論文要求的「文獻引用」格式加注，並將出處來源以論文規定的格式（例如：APA格式）書寫到「參考文獻」中。
以思維導圖先整理文獻再書寫有其優點，書寫出來的內容不會像是剪貼簿。因為思維導圖不但能統整同一主題不同學者的相同看法，也能對照出不同的意見，研究者本身也能在進一步消化吸收文獻中的精華之後，以自己的方式統整表達，以繼續後續研究。
在支幹的批注框加上已知的文獻資料