大明王朝的開國皇帝朱元璋，本是佛祖的門徒，但對風神、水神這類自然神靈也頗崇拜，信神信鬼。
《明史·方伎傳》(卷299)記載，朱元璋在與陳友諒的較量中，便請術士張中祭過風神。張中，「少應進士舉不第，遂放情山水。遇異人，授數學，談禍福，多奇中。」
朱元璋兵下南昌時，軍中總管鄧愈推薦了此人，之後朱元璋常將張中帶在身邊。陳友諒圍攻南昌時，朱元璋前去討伐，問惑於張中。張中告訴朱元璋，50天內，必能抓獲敵方將領。朱元璋遂將其帶著一起參戰，兵船到了孤山，沒有風無法前行，張中「乃以洞玄法祭之，風大作，遂達鄱陽。」在這場戰役中，朱元璋降服了5萬敵人，陳友諒在被流箭射中而死，朱元璋消滅了一個重要爭奪江山對手，奠定立國的勝局。
朱元璋甚至迷信到為一根桅桿建祠的地步。明代吳中四才子之一的祝允明，在其所撰《野記》中，記錄了當年的傳說：朱元璋當年渡江時，眼看船就要翻了，一根桅桿救了他的命。為此，朱元璋命令將這根桅桿供奉起來，並訂立祭祀制度。此祠在南京城西的清涼門外，140年後還有人住在祠旁看守，據說這是當年給朱元璋撐船士兵的後人。
朱元璋為什麼這麼相信神靈？據說與他起兵時抽到的一則簽語有關。明人郎瑛所撰《七修類稿》稱，朱元璋渡江時，桅桿折了，見江東一神廟裡有一根木頭可以代替，便要砍伐。廟裡的師傅見狀，請朱元璋抽一簽，看簽上怎麼說。遂得一簽語：「世間萬物皆有主，非義一毫君莫取。總然豪傑自天生，也須步步循規矩。」朱元璋見簽便不敢再砍伐了。
朱元璋迷信到興工動土時也要祭祀。今南京城南的中華門，這名字是後起的，不過幾十年時間，原名叫「聚寶門」。為什將都城的正南門取此名？明人謝肇淛在其所撰《五雜俎·地部一》(卷3)中記錄了這樣的說法，「相傳洪武初沈萬三所築也。沈之富甲於江南，太祖令築東南諸城，西北者未就而沈工已竣矣。太祖屢欲殺之。人言其家有聚寶盆，故能致富，沈遂聲言以盆埋城門下以鎮王氣，故以名門雲。」
把人家的聚寶盆填埋到自己的城門下，可能不少人會覺得有趣，而下面一則關於朱元璋祭神的傳說就不那麼浪漫了。
明朝在南京的皇宮是頗通堪輿術的「誠意伯」劉基卜選的，處於鍾山的西南腳邊。早在至正二十六年八月，朱元璋稱吳不久，便下令拓建應天城(南京)，劉基是重要的卜選人。經卜，決定在舊應天城東面白下門外2里多的地方增築新城，並建「吳王新宮」。吳王新宮即後來的明皇宮。新宮次年九月即告完工，速度非常快。
但營建的過程非常不順。這地方原來是一處低窪的水塘——燕雀湖，為填此湖費了老勁，朱元璋曾調集了幾十萬民工前來填湖。民間傳說，填湖前，朱元璋進行了「祭湖」活動，希望不要得罪了湖神。
由於燕雀湖面積很大，一時難以填好，朱元璋以為湖神生氣了。朱元璋便想祭祀「湖神」。聽說城南的江寧縣(今江寧區)有一位叫田德滿的老人，朱元璋便封其為「湖神」，將他捆綁起來投進湖底。說來也怪，此後工程加快，很快燕雀湖就填滿了，至今南京還有「湖神田德滿」一說。如果這是真實的話，朱元璋在商周時間「奠基牲」的基礎上，又發明了「墊湖牲」，這是十分恐怖的。
朱元璋生前迷信鬼神，當然也疑神疑鬼。這裡還有一個說法，湖填好後，工匠為新宮地基放線，朱元璋一看前方地勢不夠開闊，便將基樁向後挪了一下，問劉基這樣是否可行。劉基告訴他當然行，「但這樣一挪，將來不免遷都」。朱元璋本來就打算遷都，也未在意。城牆建好後，異常高大堅固(至今尚存)，朱元璋又問劉基，這樣的城牆誰人能越過，劉基說，「只有燕子可以越過」。朱元璋高興之餘心裡也在尋思，難道第四子、被分封在北京的燕王將來會起事？果然，朱元璋死後朱棣興兵，攻下了應天城當了皇帝，「燕子」越過了城牆。實際上，由於南京的皇宮是填湖造出來的，前高後低，下沉嚴重，幾年後新宮便出現裂縫，生性多疑的朱元璋為此犯下心病，致死未解。
朱元璋的崇神情結影響了子孫帝王，明史上有多處記載後來的皇帝派員祭祀風神、海神、江神等神靈的文字。如：
《明史·憲宗本紀》(卷13)：「七年閏九月己未，浙江潮溢，漂民居、鹽場，遣工部侍郎李顒往祭海神，修築堤岸。」
《明史·世宗本紀一》(卷17)：「二十年三月己巳，渡河，祭大河之神。」
《明史·世宗本紀二》(卷18)：「三十四年春正月丁酉朔，倭陷崇德，攻德清。二月丙戌，工部侍郎趙文華祭海，兼區處防倭。」
當然，明朝對「海神」比較重視，這可能與明朝對外交往也有關係，如明初鄭和七次下西洋，次次出航歸航都要祭海神，還在今南京下關修建了海神廟——天妃宮，幾年前，南京還修復了此宮。