和碩公主是孝莊太后的女兒，在名分上應該算是康熙的姑姑，當年為了籠絡吳三桂，後來和碩公主被指派嫁給了吳三桂之子吳應熊。雖然是包辦婚姻，但兩人在京城居住時，關係也還融洽，並育有一子。
可惜世事難料，康熙十二年（1673年），吳三桂舉兵叛亂，康熙隨即便將其子吳應熊下獄為質。在叛亂開始的時候，吳三桂這邊的形勢還不錯，一度佔領了大半個江山，於是便向康熙提出，釋放自己的兒子，並要求和大清劃江共治。康熙得報後大怒，昭示全國，要在次日午門立即處死吳應熊及兒子，以表明朝廷平叛的決心。
消息傳來，和碩公主方寸大亂，想到自己的丈夫和無辜的兒子馬上要一命歸天，不覺心如刀絞，肝腸俱斷。為了挽救丈夫和兒子的性命，和碩公主急忙換上黑衣喪服，哭天搶地趕到暢春園慈寧宮後，跪拜不起，向孝莊太后苦苦求情，要孝莊太后看在自己和外孫的面上，去求康熙放他們父子一條生路。
孝莊太后見和碩公主哭成這個樣子，也是老淚縱橫，心有不忍，心想一邊是自己親手帶大的公主和外孫，另一邊是自己的孫子和朝廷威嚴，正當她左右為難的時候，來慈寧宮向太后請安的康熙在門外已經看到了剛才所發生的一幕。
康熙聽後不覺長歎一聲，也只好心一硬，走進屋，便跪在孝莊太后面前道：「皇祖母，現在前線將士們正在流血流汗，吳三桂的氣焰囂張，不殺吳應熊就不能夠鼓舞士氣，這件事恐怕我不能答應你！」隨後，他又對悲痛萬分的和碩公主說；「姑姑，您的心情和苦處我不是不知道，但是，不殺吳應熊，吳三桂一定會更加猖狂，到時候，豈不是會有更多的人死於非命？侄兒孝義不能兩全，也只能請姑姑體諒了！」
次日午時，吳應熊和兒子便被絞死，並昭告全國。還算看在皇親國戚的分上，吳氏父子給留了個全屍。眼見自己的丈夫和兒子做了政治的犧牲品，和碩公主對此也只能是欲哭無淚。政治是殘酷的，康熙的鐵石心腸和不徇私情，可見一斑。
遇此大禍的和碩公主從此也就心灰意冷，一心向佛，後來她路過五台山殊像寺，見寺後西北角有個偏僻的客堂，便將它改名為「善靜室」，並留下來作為自己的修習之所。但是，沒過多久，有人密報和碩公主和寺內一和尚經常在一起研討經文，兩人之間似乎有些曖昧，萬一傳出去，恐怕會對皇室聲譽不利。
康熙聽後非常生氣，便偷偷的派人去五台山殊像寺放火，想把寺廟全部燒燬，也乘機把和碩公主和那和尚一起處理掉。但令人驚訝的是，熊熊大火燒了三天，殊像寺被燒得片瓦無存，唯獨「善靜室」卻絲毫未損，和碩公主和和尚們也安然無恙。
康熙得報後，認為這是天意，想必和碩公主也沒有所謂的「愛戀」緋聞，便下令重建殊像寺。後來為了紀念這段故事，有人便提議把殊像寺改成「清白寺」或「無瑕寺」，以示和碩公主的清白。不過，由於五台山是文殊菩薩道場，殊像寺的名字一直沿用至今。
滿人本是關外的遊牧民族，入關前尚處於奴隸社會的晚期，風俗粗蠻未開化。儘管在皇太極的時候曾經頒布過禁令，禁止皇族內部亂倫婚娶的事情發生。但是，風俗的改變並非是一天兩天的事情，譬如在皇太極死後就發生了皇太后下嫁攝政王（多爾袞盜嫂）的亂倫事件，而當時皇族視之當然，並不為恥。
一直到康熙時期，還曾發生過類似的事件。《清代外史》中記載，康熙年間有位格格是皇太極的幼女，順治的妹妹，輩分上算是康熙的姑母。順治遁入空門時，這位格格因為年幼，尚未出嫁。康熙即位後，此女也一直留在宮中，後來，有大臣請求為之遣嫁。康熙聽後，說：「現在還談什麼嫁不嫁的，我早已納為妃媵了。」
臣屬們大吃一驚，說：「宮闈之類乃王化所基，倫常不能紊亂。今公主於皇上乃是父親一輩，皇上怎麼能娶自己的同姓之姑為妃呢？」康熙頗不以為然的說：「未必。所謂同姓不婚，指的是母與姊妹及自己所生之子女，若是姑母輩，既非我母，又非我女，也不是我同生的姊妹，就算納之為妃，也沒什麼。」大臣盟聽後極為惶恐，力諫不可，但康熙終究還是不聽。
電視劇《康熙大帝》裡有個蘇嘛剌姑，恐怕就是由這個事情演繹來的。在歷史上的皇帝中，康熙的生育能力是最強的，一生中養育了五十二個子女，實屬罕見。康熙一生身體強健，即使到晚年，也是雄風不減當年，其好色之名，時人也偶有語及。
據說在康熙年間，名臣張廷玉的弟弟張某在京為官，當時還有另一漢人官宦世家姚氏，兩家世代通婚，張某的老婆姚氏，當時號稱國色天香，在京中漢人朝官中，其美色在這些人的妻妾中公推第一，張某心裡也好不得意。
不料有一年皇太后祝壽，詔令漢官命婦也同滿人官命婦一同進宮叩祝。後來張家和姚家的女眷便精心打扮，盛裝朝服的跟隨眾人進宮為老太后賀壽。到了之後，康熙也在那裡，皇太后很高興，便在內廷中賜宴，讓這些人在宮裡好吃好喝，隨便遊玩，玩了一天才散。
出宮後，這些女眷們散後便仍舊乘坐原先的肩輿回家，其他人都安然無恙，只有一家出了問題。當時傳聞說某京卿張某的老婆，回來的時候衣服雖然仍舊是原來的衣服，但人卻已經面目全非，根本不是原來那個人。張家和姚家雖然知道是怎麼回事，卻畏禍不敢聲張。由此，漢官命婦入宮之例，便從此停止。
康熙一生中總共有52個子女（32子20女，其中12子9女幼殤），是中國歷史上子女最多的皇帝。皇帝不用實行計劃生育，不過，女兒多點無所謂，但兒子多了就不好辦了，畢竟皇位只有一個。
清朝前期奉行「有德者即登大位」，而不是嫡長子繼承製。但「有德」這個評價標準在現實中不好操作，遠不如血緣關係來得固定可靠。正因為如此，各皇子才為爭奪皇位而打得不可開交。
本在康熙十四年的時候，皇后所生的皇次子胤礽被冊立為皇太子。事實上，在胤礽之前還有一個哥哥，即皇長子胤褆，但由於他的母親只是一般的嬪妃，而皇次子胤礽的母親是皇后且年紀輕輕又死了，皇后臨死前，康熙十分痛惜，為了滿足她的最後願望，便決定立其子胤礽為皇太子。
但是，在康熙四十七年的時候，皇太子胤礽以「賦性奢侈」、「暴虐淫亂」、「語言顛倒，竟類狂易之疾」為由被廢。過了一年，又說胤礽「雖被鎮魘，已漸痊可」，恢復了其皇太子的地位。但是，僅僅過了兩年，康熙再次以「狂疾益增，暴戾僭越，迷惑轉甚」的借口，將胤礽永久廢黜並加以禁錮。
表面上看來，好像是皇太子得了精神病，但民間多說其真正原因並非如此，而是在康熙四十七年的時候，發生了這樣一件觸犯聖怒的事。
這年，康熙帝出巡塞外，興致很高，把自己最喜愛的小兒子胤衸也給帶上了。但是，塞外畢竟不是皇宮的溫室，一行人在路上風餐露宿的，加上氣候變化多端，結果出身在深宮大院的胤衸抗不住風寒，在路上就得了重病。康熙帝對此子十分溺愛，一下子變得手足無措，急令御醫趕來診治。在胤衸病重的時候，據說康熙甚至不分晝夜的親自照料胤衸，還經常把小兒子抱在懷中，但是，胤衸最終還是不治身亡。
胤衸死後，康熙痛苦萬分，但更讓他傷心的是，其他的皇子對胤衸的病情漠不關心，甚至根本就是無動於衷，特別是作為兄長的皇太子胤礽，在自己的小弟弟生病的時候幾乎不聞不問，就連胤衸病死了，都沒有絲毫哀傷的表示。由此，康熙對自己的這些兒子們十分的失望，特別是對皇太子胤礽，更是失望之至。
這時，又發生了一件「帳殿夜警」的事，更是讓事態火上澆油。原來，在胤衸病死後，康熙對皇子們大發雷霆，喜怒不定，這讓這些皇子們感到十分恐慌，而皇太子胤礽挨了罵，更為的忐忑不安。由於心情緊張，皇太子胤礽派出自己的親信去偵察康熙帝起居，其本人也曾在夜間偷偷到康熙帳前窺視動靜。不巧消息走漏，其他皇子便把此事密告了康熙。
康熙聽了大為震怒，隨後便召集了所有的隨從大臣和武將，並令將太子和其他皇子全部拘來。康熙當著大臣們的面，痛罵這些無情無義的兒子們，特別是對皇太子胤礽，康熙更是新帳老帳一起清算，痛罵道：「你實在是太不像話了！太過分了！你平時奢侈無度，比我的花費還要厲害，倒也算了，派你去南巡，你竟敢向當地的官員索賄納賄，膽子也大過天了！連外邦進貢的物品，你，你都敢貪入私囊！」
康熙想到最近發生的事情，越說越氣：「你幼弟十八阿哥病危，我日夜照料，焦慮萬分，你身為兄長，竟然可以無動於衷，你這樣毫無孝悌的人，怎麼能當太子？你還敢在深夜裡向我的帳殿窺視，難道你是想看我死了沒有嗎？你的親信日夜監視我的一舉一動，到底用意何在？」
說到這裡，康熙痛哭流涕，對這些兒子傷心不已，幾近昏厥。最後，康熙宣佈：「胤礽廢去太子名號，他這樣的人不能繼承祖宗的家業！」
不過，話說回來，也是因為康熙兒子太多，皇子們之間很少有親情的，即使是同母所生（如四阿哥（雍正）和親弟弟十四阿哥）。但最關鍵的原因是，皇子們對大位都是覬覦已久這一點，皇太子胤礽是不可能不知道的，他平日的緊張心情也大都是由此引起。
但是，康熙雖然兩次廢立太子，但仍舊無法解決諸皇子為爭奪儲位的紛爭。在康熙年老力衰後，各皇子更是結黨營私，勾心鬥角之勢日益嚴重，而老年的康熙也沒有能力再去處理好這件事。最終，康熙至死之前都沒有公佈皇儲人選，這樣也就有了雍正繼位是否正統的爭論。
康熙廢黷皇太子胤礽，官方說法是因其瘋癲狂躁，已不能為君，但民間卻傳說這是雍正下迷藥所為。清人筆記《十葉野聞》捲上記載了這樣一個類似於武俠的故事。
相傳胤禛（即雍正）少年時，經常隻身行走江湖，結交奇人異士，以備日後不時之需。有一次，胤禛漫遊到河南嵩山，便隱瞞身份進了少林寺，拜了少林武僧為師，並在那裡習武半年，後來，師傅見他並非學武之人，便教了他一些皮毛後贈他一鐵杖讓他下山。
回京途中，胤禛遇到太子賓客在街上仗勢欺人，把人家打得滿臉是血，當時卻又無人敢管。胤禛心中不平，便走過去問苦主為何如此，旁邊的惡少年大喝道：「你是什麼人？敢來管這閒事？你難道有三頭六臂，不想活了不成？」胤禛大怒，盯著此人看了半響，突然抽出鐵杖猛擊其頭，致使那惡少年腦碎而斃，太子賓客見惡少年被打死，嚇得一哄而散。隨後，胤禛便從容返回自己的王府。
太子黨人得知後，深夜派遣劍客入雍王府準備行刺胤禛。當夜，胤禛正在一喇嘛的陪侍下誦經，突然見窗外白光閃閃，上下無定，覺得十分古怪，便命喇嘛去看看怎麼回事。喇嘛說：「不用，我已派某力士去辦了。」
第二天早上起來，胤禛見院中的樹枝都有如刀削，蓄養之獵犬也有身無頭，還有數十名武士橫屍園中。胤禛正驚詫間，喇嘛過來稟告說：「這些都是昨晚來行刺的劍客，他們技窮力竭，被力士所殺。今晚他們可能還要來報復，請殿下當心。」
胤禛聽後，趕緊命手下侍衛嚴加防範。當晚，果然西風四起，風聲鶴唳，屋宇震搖，只聽見屋頂上金鐵鳴動，兩邊人馬在屋頂決鬥，匡匡當當，甚為激烈。周邊的居民聽得膽戰心驚，但沒人敢去看個究竟。
次日，太子宮的人皇皇然的出去搶購數十棺木。雍王府也是如此，人員走進走出，十分緊張，當時人想一定發生什麼大事情了。這時，太子宮和雍王府都在廣招喇嘛前去誦經作道場，朝中大喇嘛被雍王府先招了去，不料他前腳剛進，後腳就有人命令他立刻趕去太子宮。大喇嘛礙於雍王府的情面，說不能覆命。太子聽後大怒，揚言要將大喇嘛捕殺。大喇嘛心裡害怕，便托國師求情才逃過一劫。太子知道是雍王府所為後，極力要報復。
這時，有個奇士從四川來，到雍王府求見胤禛。兩人一見，胤禛發現原來以前結交過的好朋友，十分高興，便留他下來，談論技擊武藝。兩人正談得開心，奇士突然作色道：「殿下有難，為什麼不告訴我啊？」胤禛問：「你怎麼知道？」奇士道：「聽說太子宮新得一奇人，能以鐵冠在百里之外取人首級，今晚就要來禍害殿下了。幸好天不絕殿下，讓我得知此事，今天是特來報訊的。」胤禛問：「那你有什麼辦法對付嗎？」那奇士冷笑一聲：「他是以喇嘛咒語為護符施展其魔術的。今晚我們以貝葉蒙首，那鐵冠必然來而復去。我們可以先在庭外張一袈裟，就像蜘蛛張網一樣，鐵冠到時必然跌落其中，我們就可以先收了備日後之用。」
當晚胤禛聽從其言，果然獲得鐵冠。太子聽說鐵冠丟失，十分惱怒，爾後竟然積恨成疾。胤禛得知後，派大喇嘛前去太子宮，說：「我有阿肌穌丸，可以治殿下的病。」太子道：「你上次不是在幫助胤禛嗎？我哪裡敢吃你的藥？」大喇嘛說：「哎呀，不是這樣的。胤禛暴虐，眾叛親離已經很久了。他現在已經遨遊四方，不敢回來，殿下要是不信，可問某喇嘛。」某喇嘛本是太子的親信，但其實也是大喇嘛的徒黨。太子不知其計，便問某喇嘛，喇嘛說：「大喇嘛是西天活佛之師，其丸能治百病。服之必然有效。」太子相信了他，便令大喇嘛進藥丸服用。
阿肌穌丸本是媚藥，或興奮藥，並不能隨便亂用，濫用必然致使神經中樞受到過度激刺，最後形態顛狂，無法自制。幾天後，太子果然便發狂了，大喊大叫，毀壞身邊器物，最後連大小便都失禁了。太子妃大駭，趕緊上報康熙帝。康熙帝派人去看視，得到回復說太子已不復成禮，安靜的時候像得了大病一樣奄奄一息，躁動的時候就像野獸一樣狂呼亂叫。康熙不得已，只好下詔廢其儲位。