對於福康安的身世，長久以來都存有爭議，因為一直都有傳言福康安是乾隆的私生子。那麼，福康安的父親到底是乾隆還是傅恆呢？
之所以會有福康安是乾隆私生子的傳聞，是因為乾隆一直都很偏寵福康安，將他視為親生兒子一般對待。在福康安年幼之時，乾隆就將其接到身邊撫養，福康安受到的待遇與皇子無異。在福康安入仕之後，也一路扶搖而上，不斷加官進爵。
在福康安平定苗疆之時，還被破格封為貝子，這是在以往的歷史中絕無僅有的。在他死後，也極為哀榮，乾隆表現地悲痛欲絕，加封福康安為郡王，並讓其子孫得以世襲。異姓封王並不利於皇權的集中，但是乾隆卻讓福康安這個外姓人享有皇族子弟才有的爵位，可見乾隆對福康安的寵信已經到達了平常人難以企及的高度。也正是因為乾隆對福康安過分的恩寵，關於私生子的傳言才會甚囂塵上。
在福康安死後，嘉慶帝曾不止一次地以各種理由對福康安進行譴責，甚至將其長子世襲的貝勒爵位降為貝子，直至革除，將其子發配邊疆為止。有人說，嘉慶帝這樣打壓福康安的兒子，是因為嘉慶帝對福康安一直心懷嫉恨，而福康安已死，他只能將怒火發洩到其子的身上。如果，福康安真的是乾隆之子，那麼嘉慶帝與富康安就是兄弟，兄弟之間的妒忌是很平常的事。
其實，除了福康安被撫養在宮中以外，福康安的弟弟也與福長安一樣，自幼長在宮中，只是他的成就與受到的恩寵沒有像福康安一樣大罷了。福康安他雖然一再獲得殊榮，但那與他自身的功績也有很大的關係。福康安南征北戰多年，是朝廷在軍事上最倚重的軍事重臣。所以，乾隆對他的恩寵也並不是毫無理由的。
所以，福康安到底是不是乾隆的私生子，終究是難下定論。