朱伺，字仲文，安陸縣人。年輕時為吳牙門將陶丹給使。吳亡後，內遷江夏郡。朱伺勇武有膽識，但不善言談，不知詩書，為郡將督，見鄉里士大夫名宦，作揖報個姓名而已。及至做了將軍，便以謙恭著稱。
張昌作亂，江夏太守弓欽逃到灄口，朱伺與同輩郴寶、布興聚集部眾討伐張昌，不勝，便隨同弓欽奔向武昌。後來又率部黨消滅了張昌。轉任騎部曲督，加綏夷都尉。朱伺部曲等認為各縣依附過張昌，只有本部舉義討賊，邪正之間有嫌疑，請求另立新縣，因此便分割安陸東部地區為灄陽縣，作為朱伺部曲的世代居住之地。
後來陳敏作亂，陶侃當時鎮守江夏，因朱伺善於水戰，精通戰艦的製造，便派朱伺監製大型船隻，並命朱伺率部為左翼，佔據長江口，挫敗陳敏的前鋒。陳敏之弟陳恢自稱荊州刺史，佔據武昌，陶侃率朱伺及各部軍馬進討陳恢，擊敗陳恢。陳敏、陳恢之亂平定後，朱伺以戰功封為亭侯，兼任騎督。其時西陽夷人盜匪屢屢搶劫江夏，江夏太守楊珉常請軍將們商議拒敵之計，朱伺獨不發一言。楊珉說：「朱將軍為何不發言？」朱伺回答說：「諸位用口舌攻擊賊寇，我朱伺只憑武力勝敵罷了。」楊珉又問：「朱將軍多次擊賊，為什麼能常常取勝？」朱伺回答道：「敵我對峙，必須忍耐沉住氣。敵人往往沉不住氣，而我能沉住氣，因此容易取勝。」楊珉大笑。
永嘉年間(307～312)，石勒攻破江夏，朱伺與楊珉退至夏口。陶侃來戍守夏口時，朱伺投奔了陶侃，封為明威將軍。隨同陶侃討伐杜..，建有奇功，事見《陶侃傳》。夏口之亂，朱伺用鐵面具自衛，用強弩射死賊軍主將數人。賊軍將船隻拖上岸，在水邊列船為陣地。朱伺沿江上下阻截賊軍，流矢射中其小腿，依舊面不改色。各路官軍不久趕到，賊軍潰逃，朱伺率兵追擊，賊軍紛紛棄船投水逃命，死者大半。賊軍殘部乘夜逃回長沙，朱伺率部追到蒲圻，未追上而返回。朱伺以功封為威遠將軍，賜赤幢曲蓋。
建興年間(313～316)，陳聲率眾無賴兩千餘家攔截長江行船搶奪財物，陶侃派朱伺為督護討伐陳聲。陳聲人馬雖少，朱伺卻不急於攻打。陳聲請求朱伺允許他派遣其弟前往陶侃處請降，朱伺表面上答應了陳聲。等陳聲一離開，朱伺便派精壯的士兵半路上截殺了陳聲之弟，然後暗中派兵襲擊陳聲。陳聲部眾正月初一會聚一起祭祀飲食，朱伺的士卒攻入大門，陳聲方才發覺。陳聲部將閻晉、鄭進皆拚死抵抗，朱伺士卒多有傷亡，便撤回軍營。陳聲率部向東逃去，固守董城。朱伺又率各路軍馬包圍董城，在城四周立起層層籬柵，又用樹木架築高高的望樓，從樓上用強弓憑高直下射殺守城兵士，又阻斷城中水道。城中無水，被迫殺牛飲血。閻晉，是陳聲的妻弟，只好割下陳聲的頭出城投降。朱伺又以平定蜀賊襲高之功，被封為廣威將軍，兼任竟陵內史。
當時王敦打算讓其堂弟王訥代替陶侃做荊州刺史，陶侃的老部將鄭攀、馬鯭等向王敦請求留用陶侃，王敦不答應。鄭攀等認為陶侃剛剛剿滅頑賊，人人都樂意歸附他，又認為王訥忌刻凶暴難以侍奉，因而謀劃共同抗拒王訥。便集結在員口，派使者通知朱伺，朱伺表面上應許，而稱病不赴約。鄭攀等便進兵抵抗王訥。不久其部眾受阻而停滯不前，又退回橫桑口，打算投靠杜曾。當時朱軌、趙誘、李桓率部準備攻打鄭攀等，鄭攀等害怕遭誅殺，便借口屬下司馬孫景獻計抗拒王訥，將孫景斬首，向朱軌等人投降。
王訥準備率兵西進，派長史劉浚留守揚口壘。其時杜曾請求率部進攻襄陽討伐第五猗，朱伺對王訥說：「杜曾是奸猾之賊，表面上做出向西進兵的假態，以迷惑眾心，想引誘官軍專心西進，然後他將火速回兵襲擊揚口壘。必須慎重處置，不可輕率西進。」王訥生性驕傲自負剛愎自用，加之以為朱伺老邁怯懦不宜信任，便決意西進。杜曾等果然奔馳而回。王訥急派朱伺率部回援，才到揚口壘，就被杜曾等所包圍。劉浚以為揚口壘的北門形勢危急，準備令朱伺守北門。有人勸阻劉浚說：「朱伺與鄭攀是同黨。」劉浚便改令朱伺守護南門。賊兵聞知，猛攻其北門。其時鄭攀同黨馬俊等也來攻打揚口壘，馬俊的妻子兒女在壘中，有人建議剝去他們的面皮以示馬俊。」朱伺說：「殺其妻子兒女，不能解圍，只會增加其怒火而已。」於是打消了這一主意。朱伺平素用起來極順手的弩弓忽然滯澀緊閉發射不動，朱伺十分厭惡這一不祥之兆。及至賊兵攻破北門，朱伺受傷退到船上。當初，劉浚打通各船隻的底部，平時用木板閉合，稱為船械。朱伺進入船倉後，追來的賊兵舉起長矛刺向朱伺，朱伺順勢奪過長矛，反過來用長矛刺賊。賊兵爬上船頂，大叫道：「敵帥在此！」朱伺急忙打開船底從水下遊行五十步，才得以逃脫。遇見醫士療傷，傷口稍稍好轉。杜曾派人勸說朱伺道：「馬俊等人十分感激足下不殺妻子兒女之恩。如今我已將足下家中內外親屬百人交付給馬俊，馬俊已接到家中盡心照料，足下可以來與家人團聚了。」朱伺回答道：「凡是當盜賊的不得善終，老夫今年六十多歲了，不能再與足下同做盜賊。老夫死後，當歸葬南土，妻兒家人拜託給足下。」便毅然返回曾瓦山。其時王訥與李桓、杜曾相持不下，反覆交戰於曾瓦山下。軍士屢次驚呼道：「賊兵要來了！」朱伺連受驚擾傷痛而亡。死後便埋葬在曾瓦山上。