曹操大賞群下，封侯的封侯，陞官的陞官。
有一個人其實功勞才是最大的，卻不在名單中，這個人就是曹操自己。理論上曹操也是漢室的一名臣子，目前的職務是三公之一的司空，他曾經代理過一段時間車騎將軍，但這一職務後來被免去了。袁紹死後大將軍一職也空了出來，還有車騎將軍，之前由獻帝的老丈人董承擔任，董承因謀反被殺，這個職務也空了出來。
文官方面，除曹操外，現任的三公還有司徒趙溫，而太尉一職空缺，曹操曾有意讓荀彧擔任三公，指的可能就是太尉，但被荀彧堅決拒絕了。曹操還擔任了冀州牧一職，除此之外還有一個頭銜，是初到洛陽迎駕時被授予的，叫錄尚書事，算是個兼職。
朝廷的九卿裡，趙岐、陳紀、張儉、桓典等人因為年事已高這些年先後去世，對於空出來的職位，暫時無人替補，獻帝身邊的人越來越少，目前比較活躍的是孔融等幾個人。曹操這些年來重點加強了司空府的建設，使其機構逐漸龐大，內設部門不僅涵蓋了經濟、民政、司法、人事等，還設置了軍師、軍師祭酒、參司空軍事、軍謀掾等軍職，以服務戰爭的需要。
雖然曹操沒有再擔任大將軍或車騎將軍，但他的司空府實際上行使了軍政合一的職能，成為事實上的最高軍事決策機構，先後不同時期裡投奔曹操的主要文士，除荀彧等極少數人外，都在司空府任職或曾經在司空府任職。
但是一直以司空府來管理整個國家，有些名不正言不順。
在曹操攻佔鄴縣兼任冀州牧時，有人建議他恢復古代的九州制，原因是在古代九州里，冀州的面積最大，曹操現在擔任冀州牧，那樣一來勢力範圍更大，更容易為天下信服。
對這個建議曹操有點動心，佔領冀州後，他也一直在思考如何處理與許縣朝廷的關係，如果把大本營還放在許縣，將會有許多不便，不管怎麼樣，劉協都是天下人公認的皇帝，自己作為三公之一理應履行做臣子的本分，比如按時上朝、有事上報、天子隨召隨到等，這又是曹操不可能做到的。
曹操內心裡已經打定主意跟許縣的天子「分開過」了，但那樣一來，必須找出一個合理的理由和一個恰當的操作模式。而且，傳統概念上的司空府也不掌兵，以司空府來統領天下的軍政大權，時間長了也容易被人說三道四。
在這種情況下，曹操也認為恢復九州制是個好主意，可以破解當前的政治難題。九州作為古代中國的另一個稱呼是虛指，它還有一個實指，指的是九個州，即九大行政區，與現行十三個州的行政規劃有所不同。不過，如果僅僅為了增加冀州的影響力而恢復九州制，似乎有點過於興師動眾了，畢竟行政區劃的調整歷來都不是一件小事，涉及各方面的技術困難和各派勢力的利益衝突，更何況有些地區還不在曹操控制地區，能否推行下去都是一個問題。
果然，這一概念提出後立即引來眾多反對，身在許縣的荀彧聽說後也寫信給曹操，表達了不同意見：「現在如果依古制，那麼冀州的管轄範圍將包括現在的河東郡、馮翊郡、扶風郡、西河以及幽州、并州的全部，這些地方本來人心就不穩，讓他們歸屬冀州，將會使大家更加不自安。如果因此引起叛亂，那麼天下大業就不好說了。」
荀彧建議曹操先平定黃河以北的地區，修復舊都洛陽，之後南下荊州，討伐劉表、劉璋等不肯朝貢的軍閥，讓天下人都知道這些想法，從而人人自安，等到天下大定之後，再來議古制。
荀彧的這番表態，說得很有道理，卻讓曹操吃了一驚。
其實，曹操堅持恢復九州制的真實原因倒不是增加冀州的地盤這麼簡單，其背後還有玄機，可惜荀彧沒有看到。九州制是一個地理概念，或者說是一個規劃中的行政概念，但它也是整個古制中的一個組成部分，只有把它與整個古制聯繫起來看才能洞悉曹操的心理。恢復地理或行政區劃上的九州制不是曹操想法的全部，甚至不是主要部分，借恢復九州制進而恢復已經廢除的其他一些政治制度才是要害。
現行政治制度大都因襲於漢初，這套制度由高祖劉邦初創，經過漢武帝和漢光武帝等君主的不斷改造，與最初的形制已經有了很大不同。比如目前推行的三公制與漢朝初年的丞相制就區別很大，三公分了丞相的權力，有了制衡卻喪失了效率，東漢三公又長期被尚書檯等內朝官分權，有時竟形同虛設。
在曹操看來，即使高祖劉邦定下的制度有些也值得商榷，比如封爵制度，以前是五等爵制，即公、侯、伯、子、男，劉邦非要來一個白馬盟誓，稱「非劉氏不得封王」，斷了一般人的封王之路，異姓的臣子功勞再高，封到縣侯也就到頂了，逼得王莽這樣的人只好另找出路。曹操想恢復九州制，行政區劃調整才是第一步，後面還會陸續推行以恢復古制為重點的政治體制改革，目的是進一步加強自身的集權，同時在爵位分封等方面有所突破。
但是第一步還沒有邁出去，便遭到了荀彧乾脆利索的反對。
而且，繼荀彧之後少府孔融又提出了一個問題，九州制是古制，王畿制也是古制，恢復九州制，王畿制要不要也恢復？畿的意思是直屬管轄區，所謂王畿制，指的是首都為中心方圓1000里以內的都是王畿，方圓500里之內的是侯畿。孔融認為，按照這個制度，以許縣為中心，千里之內的地區都應該劃入獻帝直接管轄區裡。這就包括了豫州、兗州和司隸校尉部的大部分地區，也包括冀州、并州、荊州的一部分地區，孔融端出王畿制，顯然是跟九州制對著幹，讓你弄不成。
孔融最近以來一反初到許縣時的良好合作態度，在很多事情上都喜歡跟曹操唱反調。就孔融的這番談論曹操完全可以不理，也可以追究他的責任，問問他的動機是什麼。但現在的問題比較複雜，中間還夾著荀彧。
荀彧的表態讓曹操不能不認真對待，荀彧不僅是自己事業上的第一功臣，而且在士人中很有號召力，自己手下相當一批官員都來自荀彧的推薦。或許荀彧沒有看出來自己的真實動機，就行政區劃調整本身發表的意見，因為僅就此而言，費那麼大的勁確實有點不值，荀彧及時提出建議是他一貫責任心強的表現。
但是也有一種可能是他看到了自己的心思而執意反對，如果是那樣就麻煩了。這表明，荀彧在一些原則性問題上與自己的想法出現了分歧，這種分歧將是一個危險的信號。
不管是哪一種情況，恢復九州制的提議都不能再進行下去了，曹操下令終止關於恢復九州制的討論，他為此專門寫信給荀彧說：「不是先生及時提出反對意見，我要失去的可能更多了！」話是這麼說的，但曹操的心裡頗不是滋味。
不過，這些不良情緒在曹操心裡也只是一閃而過，他現在更關注的是下一步如何打算。統一了整個北方，他終於可以向南邊看看了。南方有三個重要的對手，從西向東分別是劉璋、劉表和孫權，先從哪裡下手呢？