曹丕原來的身份是魏王兼漢廷的丞相，禪讓之後許縣的漢朝廷、鄴縣的魏王府和丞相府都不存在了，所有人員統一歸入新朝廷。曹丕不打算再為新朝廷設置丞相，放眼曹魏內部似乎也沒有能擔此重任的人選，更為重要的是，設不設丞相體現著君權的強弱，曹丕要做強勢君王，不需要給自己的下面再培養出權臣。
丞相不設，三公還是要設的，後漢的三公是太尉、司徒和司空，曹丕沿襲了舊制。在人選上，曹丕第一個想到的是楊彪，弘農郡楊氏是前朝最著名的政治世家之一，楊彪的父親是漢靈帝的老師楊賜，父子二人在士人中均深得厚望。
曹丕派人去請，卻被楊彪一口回絕了。兒子楊修被殺後楊彪仍心有餘悸，不再過問任何政治，他對來人說：「我也當過漢室的三公，愧疚的是沒有建立尺寸之功，如果再當魏朝的三公，對國家來說並不是什麼可稱道的事。」曹丕深感遺憾，改拜楊彪為光祿大夫，品秩二千石，相當於部長級，屬於榮譽性質，又賜給楊彪延年杖、馮幾，特許他上朝時穿單衣、戴皮弁帽，站位僅次於三公，又在楊府門前設行馬，置吏卒警衛以示優崇。
清心寡慾、不問世事的楊彪最後以84歲的高壽而終，死後歸葬於家鄉弘農郡的楊氏宗族墓。楊彪的曾祖楊震被稱為「四知先生」「關西孔子」，那句「天知、地知、你知、我知」的話就出自他，楊氏宗族墓目前仍保存著楊震、楊彪等家族成員墓七座，具體位置在今陝西省潼關市吊橋鎮，黃河在潼關拐了個彎兒，楊氏宗族墓就在拐彎處的黃河邊上，由於「四知先生」的事跡，這裡被建成了一處廉政教育基地。
楊彪不願意幹，下面就是鍾繇、程昱、華歆、王朗、賈詡等幾個人，他們的名望和資歷都差不多。鍾繇、程昱追隨曹操的時間最長，他們屢建奇功，是能武又能文的重臣；華歆、王朗在社會上聲望頗高，也是先帝手下的名臣；賈詡智慧過人，是為數不多的幾個深為曹操所佩服的人，在曹丕立太子過程中發揮過重要作用。
經過權衡曹丕最後選賈詡為太尉、華歆為司徒、王朗為司空，鍾繇、程昱雖然是曹魏的「嫡系」，但都因為各自原因而落選。
程昱的落選還是當年的「人脯」事件，他曾把人肉乾當成軍糧，在儒家看來只有禽獸才吃人肉，程昱因此備受詬病，之前已多次與三公之位無緣，新朝廷要展示新形象，儘管程昱在別的方面無可挑剔，曹丕還是不敢用他。曹丕讓程昱擔任九卿之一的衛尉，相當於京城警備司令，負責洛陽的保衛工作。程昱活到了80歲，死後追贈為車騎將軍。
鍾繇的落選是因為不久前發生的魏諷謀反事件，魏諷是他的下級，鍾繇因瀆職而被處分，免去了職務，曹丕繼魏王后剛剛復起鍾繇為魏國大理寺卿，馬上就出任三公不太合適。曹丕繼續發揮鍾繇的特長，任命他為九卿之一的廷尉，相當於司法部部長。鍾繇這位書法家活到了79歲，死後被追贈為太傅。
曹丕對三公的人選很滿意，有一次罷朝後看著他們的背影高興地對左右說：「你們看看這三位，都是一代最傑出的人物啊，以後估計再也難以超越他們了！」三公以下是九卿，已有程昱、鍾繇兩位，剩下的由董昭、和洽、邢貞等人充任，他們也都是老臣，追隨曹操多年，立過各種功勞。
從曹丕的新班底來看似乎用的都是「老人」，其實並非如此。
這是因為，三公九卿並不是曹丕人事佈局的重點，真正的權力核心在尚書檯。漢武帝劉徹創設尚書檯的目的是分丞相、九卿的權，這個機構相當於朝廷的秘書局，不僅負責處理中央各衙署之間、中央與各州郡之間的公文往來，還參與各種重大決策的制定，是真正的權力核心。曹丕基本沿用了漢朝尚書檯的設置，長官為尚書令，副長官為尚書僕射，下設若干名尚書。
曹丕選的尚書令是桓階，尚書僕射是陳群和邢顒，另選司馬懿、陳矯、衛覬、崔林、杜畿五人為尚書，這才是新朝廷真正的班底。
相比於司馬懿、陳群，桓階這個名字有些陌生，之前對他也介紹過一些。他是荊州刺史部人，經歷頗為傳奇，早年他曾在孫堅手下幹過，得到過孫堅的賞識。孫堅死後他冒險發喪，又被劉表欣賞，劉表想把妻妹嫁給他，被桓階拒絕。官渡之戰時桓階策動荊州的江南幾個郡反叛，牽制了劉表，此舉被曹操視為官渡決勝的關鍵之一，曹操南下荊州後即把桓階找來延至麾下，十分信任。曹丕重用桓階的原因之前其實已經提到，在奪嫡之爭中桓階堅定地站在曹丕一邊，與其他人不同的是，他不僅表態支持曹丕，而且不顧猜忌，多次主動地向曹操密諫，認為曹丕德優齡長、宜為儲副，每次態度都十分堅決懇切，曹丕對他深為感激。
與桓階一樣，邢顒也是著名的「太子黨」，他最早其實在曹植的平原侯府任職，但他看不慣曹植，與曹植性情不合，後調離平原侯府，看到曹操有「廢長立幼」的打算，邢顒也多次勸諫。
陳群和司馬懿更不用說了，是曹丕的「死黨」，讓他們一個擔任尚書僕射、一個擔任尚書，主要考慮到他們的名望、資歷還較淺，需要一個培養的過程。陳矯、衛覬、崔林、杜畿等人則是有名的實幹家，他們都在地方上任郡太守多年，很有業績，瞭解下面的情況。
曹丕為自己打造的這個核心班底，是由絕對信任的人和實幹家組成，是一個有實力、信得過的班子。
桓階身體不好，第二年便去世了，陳群和司馬懿於是各升一級，一個擔任尚書令，一個擔任尚書僕射。又過了一年，邢顒改任司隸校尉，司馬懿成為朝廷秘書局的尚書左僕射，杜畿升尚書右僕射。
至此，曹丕在政務方面的左右手分別到位，陳群和司馬懿這兩個政壇新星冉冉升起。
在軍事上，與魏王時期相比也有一些新變化。
夏侯惇死後，他所擔任的大將軍一職空缺，按說應該由現任軍職最高的曹仁補上，但曹丕沒有表示。曹仁仍任車騎將軍；曹洪任衛將軍，不過只是掛個名。
前、後、左、右將軍分別任命了張遼、張郃、徐晃、朱靈，他們四人隨便拉出來一個都是響噹噹的一代名將，為曹魏大業連年征戰，肝腦塗地，屢建殊功。典韋、許褚戰死了，不然輪不到朱靈，還有一位本應是四方將軍中的第一位，但兵敗降敵，關羽被殺後又被「接管」到了孫吳，這就是於禁。
上面都屬「論資排輩」，再往下就是「諸夏侯曹」第二代年輕將領的天下了，曹真、曹休以及夏侯淵的兒子夏侯霸、夏侯威，侄子夏侯尚，夏侯惇的兒子夏侯楙等紛紛脫穎而出，迅速走向前台，逐漸從父輩們手中接過兵權。
曹真擔任鎮西將軍，坐鎮關中一帶，他成為曹魏西線戰場的總指揮；曹休開始擔任領軍將軍，是禁軍的統領，不久晉陞為鎮南將軍，成為曹魏中線戰場的總指揮；夏侯尚開始擔任中領軍將軍，也是禁軍的首領之一，很快就晉陞為征南將軍，成為進步最快的一個。夏侯楙後來擔任了安西將軍，夏侯霸、夏侯威擔任了右將軍，在曹丕的提攜下他們都迅速成長起來。
文有陳群、司馬懿，武有「諸夏侯曹」第二代，這就是魏文帝曹丕總體的人事佈局。
對曹植、曹彰等這些兄弟，曹丕的政策是分散遣送到各地，理由是他們都有各自的封地，現在應該到那裡去。為了加強對這些兄弟的控制，曹丕還專門給每個人派去一名特派員，負責監督封國的情況，發現問題可以直接向曹丕報告。
自從曹丕被確立為太子，曹植就承認了失敗，別人上勸進表，他也上了一份，曹丕讓他們就國（當隨例），他乖乖去了平原國。曹丕派去監督曹植的人名叫灌均，此人為迎合曹丕，上表密奏說曹植酒後行為不端，還劫持威脅朝廷特派員，有關部門隨即上報請求治曹植的罪，曹丕本想給予嚴懲，後在太后的干預下僅作貶爵為安鄉侯的處罰。
為防止被天下人議論，曹丕還特意下詔說：「曹植是我一母同胞的兄弟，我對天下都無所不容，何況曹植呢？骨肉之親哪裡捨得殺害？所以予以改封。」
在野史裡記載了一件事，說曹丕稱帝后對曹植仍心懷忌恨，有一次命曹植在七步之內寫出一首詩，如做不出來就將行大法處死，但曹植不等其話音落下便應聲而出：「煮豆持作羹，漉菽以為汁。萁在釜下燃，豆在釜中泣。本自同根生，相煎何太急？」這首詩又被小說家演化為只有四句的《七步詩》，知名度很高。但曹丕稱帝后他們兄弟二人見面次數極為有限，曹丕拿作詩這種小把戲為難詩才橫溢的弟弟，於情於理於客觀情況都不大可能。被貶後曹植很快又被改封為鄄城侯、鄄城王，一直過著心驚膽戰的日子，遇事無不小心謹慎。
有一次曹植奉詔入京，快走到洛陽時突然內心裡感到了無名的驚懼，就丟下隨行人員騎馬微行入京，他偷偷地去見了大姐清河長公主，想讓她帶著自己到哥哥面前請罪。
曹植不見了，關吏不敢怠慢馬上報告，曹丕派人沿著來京的路線搜尋，沒有找到。太后聽說後認為曹植自殺了，在曹丕面前痛哭。過了一陣曹植散著頭髮、光著腳並且自行背負刑具來了，太后才轉悲為喜。曹植後來又被改封為雍丘王、東阿王，不僅有人監管，而且封地也變來變去，日子很不好過。
曹植的哥哥曹彰也沒好到哪裡，曹操在時封他為鄢陵侯，曹丕稱帝后晉陞他為公爵。曹彰本以為自己與其他兄弟不同，他帶過兵，對國家有用，所以應該另有安排，但詔書下來他也跟兄弟們一樣就國。曹彰很不高興。鄢陵這個地方也不好，屬經濟落後地區，曹彰想改為中牟，這裡不僅經濟發達而且離洛陽不遠，曹丕答應了，封他為中牟王，但不久就改封為任城王。曹植奉詔入京的那一次曹彰大概也來了，但他卻莫名其妙地暴死在洛陽。
有野史說，曹丕邀曹彰在卞太后那裡下棋，一邊下一邊吃棗，曹丕把毒藥弄在棗蒂中，自己只吃沒毒的，曹彰不知道結果中毒。卞太后拿水想救他，曹丕早已密令左右把瓶罐都毀了，卞太后急得只能光著腳跑到井邊想去取水，可水還是沒打上來，過了一會兒曹彰就死了。
這個記載也不足信，曹彰是不是曹丕殺的先不論，即使是，曹丕殺個人也不必費這麼大的事，更不會當著母親的面，這個記載與《七步詩》一樣都屬於杜撰。
不過，曹丕稱帝后曹彰、曹植以及其他幾位宗室的處境確實很不好，遣散出京、一再遷封，內部又有人監視，過的日子連普通人都不如。