大荒神帝神農氏於南際山仙去，臨終之際，結識流浪少年拓跋野。其時大荒內亂將起，黑水真神蝕龍日漸張狂，竟派遣兵將圍剿大荒中的自由之邦——蜃樓城。為解大荒之亂，拓跋野臨危受命，攜神帝血書令符踏上大荒。
途中，拓跋野屢逢奇遇，並於深崖寒潭之中，伏靈獸白龍鹿，得木族神劍。此時翠屏山中，水妖龍女雨師妾張網以待，輕鬆俘獲拓跋野。多情龍女雨師妾，翩翩少年拓跋野，兩人日久生情，不能自拔。其時蜃樓城聲勢日大，各族遊俠皆前往聲援。荒郊野棧，白髮浪子科汗淮力挫群雄，令拓跋野心折。在科汗淮的帶領下，眾遊俠突破水妖封鎖線，終得以進入蜃樓城。拓跋野身為神帝使者，血書令牌一現，水妖重兵悄然撤退。蜃樓城中，拓跋野與城主喬羽之子蚩尤脾性相投，結為好友。科汗淮之女纖纖年齡與他們相仿，也相處甚歡。好景不長，水妖夜襲蜃樓城。因為內奸的出賣，自由之邦一夜傾城，科汗淮、喬羽下落不明，拓跋野、蚩尤、纖纖飲恨漂泊。
三人漂流至大荒罪囚的流放地——湯谷島，卻陰差陽錯地被眾囚奉為神人。二少年將錯就錯，以湯谷為根基，組建湯谷軍，期重振蜃樓城。蚩尤更自機緣巧合，吸收了被困湯谷多年的前木族青帝羽卓丞元神，並得本族神器——苗刀。
其時水妖勢力漸長，東海之上，湯谷軍大敗水妖聯軍，成就威名。東海龍神駕臨湯谷，意外見到纖纖，道出一段不為人知的隱秘來。纖纖傷心欲絕，孤身踏上大荒，前往崑崙尋找生身母親——西王母。拓跋野與蚩尤為尋纖纖，再次踏入大荒。
其時大荒已是危機四伏，火族聖盃失竊，纖纖被捲入失竊疑案，拓跋野、蚩尤二人為幫纖纖洗脫罪名，再次捲入大荒爭端。火族逼供，纖纖夢囈聖盃落入雷神之手。拓跋野深入都城，與火族群雄一起踏上尋訪之路；蚩尤暗中追尋，卻遇上化身纖纖的九尾狐晏紫蘇；此時，東海龍六攜湯谷群雄齊至大荒。數人經過磨難，終於在雷神府中相遇，豈不料，竟集體陷入了木妖的圈套。雷神府禍亂驟起，雷神含冤逃走，寧姬莫名慘死，聖盃竟被劈成兩半。為將聖盃復合。眾人兵分兩路，分別踏上了尋訪土族朝歌山七彩土之路。
群雄遠赴朝歌山，卻恰逢土族貴人夭亡，拓跋野等途中突逢戰鬥。流沙仙子洛姬雅與土族少主姬遠玄密林深處大肆拚殺。拓跋野幫助姬遠玄逃得一難，並得知土族黃帝遭人暗殺，急需七彩土復活。在拓跋野的幫助下，姬遠玄拜會靈山十巫，得到十巫相助，將黃帝救活。拓跋野與十巫鬥智鬥勇，並在洛姬雅的幫助下取得了神醫的稱號。當是時，土族都城卻叛亂連連，土族大太子意自篡奪王位，在拓跋野等人的幫助下，姬遠玄挫敗了土旅叛軍的陰謀，土族重歸和平。
拓跋野等人攜帶七彩土再次回到火族，其時火族都城已是暗流湧動，大長老烈碧光晟困囚赤帝，意圖篡位，烈炎等人身陷重圍，危在旦夕，戰爭一觸即發。拓跋野鋌而走險，智救火族群雄；蚩尤奮不顧身，怒闖烈焰火山：赤炎山爆發噴薄，金猊獸咆哮出世，眾人再次身陷險境。豈不料，金光塔變故驟起，赤帝脫困出關，戰亂再度升級。大荒雨師，土族援軍，火德之身，赤炎山頭好戲連台。最終，火族戰亂平息。大荒重歸平靜。
大荒格局暗顯，火族南北並立，土族大亂方定，水族木族蓄勢待發。五族之中只有金族保持中立。恰逢此時，纖纖再次負氣出走。拓跋野與蚩尤為尋找纖纖再次踏上歷險歷程。在追尋的道路上，他們來到了大荒西陲寒荒之國。
其時寒荒卻是禍亂連連：上古妖獸復出，國民離奇失蹤。八族一齊叛亂。幕後黑手西海老祖不斷興風作浪，攪得寒荒大地一片大亂。二人在寒荒義士們的幫助下，共同斬妖除魔，解除寒荒危難，挫敗西海老祖的陰謀。在金族少主少昊的幫助下，他們也順利找到了纖纖，並將纖纖送往西荒金族其母親所在地。豈不料，一波未平一波又起，西荒竟驚現屍蠱，無數大荒義士為屍蠱所控，成了嗜血妖魔。為查出真相，拓跋野與蚩尤深入西荒，卻驚奇發現失蹤已久的蚩尤之父喬羽、纖纖之父科汗淮等人都遭屍蠱所困，神志不清。蚩尤心急救父，強下九泉，勇闖鬼府，大戰鬼府眾魔，卻被幽天鬼帝屍蠱所困，成為傀儡。
蟠桃大會如期召開，各族顯貴要人齊聚崑崙瑤池。水族燭真神野心勃勃，暗地挑動五族不合；火族雙帝齊至，劍拔弩張；木族暗附水族，蠢蠢欲動；土族動亂方平，蓄勢待發。蟠桃大會，群英畢集，卻都是各懷心思。豈不料禍亂驟起，蚩尤被幽天鬼帝所蠱，奮而刺殺土族黃帝，引起大亂，立刻成為五族公敵。拓跋野等人奮力救護，惹來麻煩連連。水族野心家藉機四處挑撥。一時間，蟠桃大會風波頻頻，硝煙四起。拓跋野在西王母與白帝等人的幫助下，挺身而出，與火族、土族、龍族、金族等人共同結盟，將局勢控制，並藉機將蚩尤救出，助其擺脫屍蠱控制。
幽天鬼帝竟突襲會場，率領鬼府兵將大鬧崑崙，並亮出了真實身份，原來鬼帝竟是失蹤己久的水族黑帝。一時間，無數的舊日恩怨再次提起。崑崙山戰雲再起，蟠桃大會頓成修羅殺場。最後的時刻，拓跋野再逢奇遇，得自己的前世金族奇人古元坎相助，習得奇功，一舉擊敗黑帝與燭真神，並獲得「大荒天下第一」的稱號，與蚩尤一同帶著自己的愛人飛向茫茫東海。