現在必須詳細說明靜坐與氣機的關係和作用，但是首先必須先要瞭解一個觀念，這是指一般已經成年以後，以及已經有過男女性生活以後，乃至包括老年人的情況而言，至於未經成年的童身，那又須另作別論了。
第一反應--腿部的麻脹。在開始練一習一 靜坐時，如果沒有以上所說的那些先入為主觀念的存在，或者能夠泯除這些似是而非的觀念，他所感覺最大的困擾，便是心理的不能平靜和生理反應的各種奇異的感受。關於心理的平靜與散亂問題，留待將來討論靜坐與心理關係時再加說明。現在所要討論的，只是偏重在生理內部氣機的反應。關於這個問題，根據通常開始練一習一 靜坐的統計資料，十之八、九，便是靜坐時，經過一段短暫的時間以後，首先引起感受上的壓力的，便是兩腿發麻或發脹。於是促使渾身酸疼或不安，甚至，連帶引起心理的不寧靜。如果從一般生理衛生常識來講，大多都認為那是兩腿的血管被壓迫的關係，等於一個通常不練一習一 靜坐的人把兩腿一交一 叉疊起，如不隨時變更一交一 換只是保持一個姿勢經過一段的時間，便有腿麻的感覺，於是就認為它是很不好的現象。
倘使從靜坐的經驗來講，這種現象，並非完全是血管被壓制的關係，實在是氣機開始發生了反應的作用。因為氣機在筋脈血管肌肉之間，不能暢通流行，所以有了脹痛麻木的反應感覺。換言之，這便證明了在生理上的陰蹻、陽蹻的氣脈上，已經有了後天的障礙。反過來講，當腿麻到不能過分忍受時，只須輕鬆的放開兩腿，慢慢地讓它自然舒暢之後，便會感覺到由於經過這一段短暫時間的壓迫，而換得新奇的舒服和快感。事實上，當靜坐工夫到達某種適當的階段時，無論盤腿或不盤腿，這種新奇而舒服的快感，是長期永恆地存在。此時，雖然長期盤腿而坐，不但沒有妨礙，這種舒服和快感，反而愈來愈盛。
第二反應一一生殖機能的勃興和其他。有關靜坐對於生殖機能的反應，為了講解的方便。必須把它分為（一）腎臟機能（二）生殖機能兩部分來講，因為在成年人練一習一 靜坐時，最初有反應的大多數是從腎臟部分（包括腰部）開始。日久工深，生殖器部分才發生反應，如果是少年人一習一 坐，很多都是由生殖器部分先發生反應。
（一）腎臟部分的反應：即是說靜坐的時候，或在靜坐過後，腰背會發生脹、痛、酸、麻等情況。倘使因腎虧而患有陽萎、早洩、遺精病的人，可能因靜坐的關係，反而更有遺精或早洩的現象。如果不得其法或不知對治，甚之有至於白日遺精，大小便隨時遺精，與靜坐時遺精的嚴重症候。關於這些現象的來源，中醫認為是腎虧的關係；西醫認為是與腎臟或腎上腺、性腺和腦下垂腺，以及神經衰弱等因素有關。若是女性練一習一 靜坐，素來患有腎虧等症，不但腰部疼痛不堪，甚至會有白帶等現象發生。其實這不是因為靜坐的關係而產生這種不良 的後果與副作用。實在是因為靜坐的關係，發動身體內部氣機的潛能，在將要通過而尚未通過腎臟與腰部的階段，由於這些部位的神經與腺路有了宿疾的障礙，所以引起這些症狀的並發。如果知道了這個原理，再得明師指導而知道對治的方法，只要過此一關，則一切有關這一部分的宿疾頓消，恢復健康壯盛，自然不成問題。倘使沒有明師的指導，不知對治的方法，最好是暫時停止靜坐，等恢復健康時，再來靜坐，如果又因靜坐而重發時，就不妨再停。如此持之有恆，再病再停，再停再坐。久而久之，自然就會完全恢復健康。因為對治的方法大多，而且要因人而施，因病而治，或者運用身體運動的各種不同姿態，再配合醫藥的調整，相當繁複，故只能說到如此而已。但在此階段，最要緊的守則，必須要絕對斷絕男女的性行為，倘使能做到不但沒有性的行為，而且無性的慾念，那便是真正無上的大藥，決定可以及早恢復健康。至於健康恢復中的變化反應，則因男女性別、年齡老少、體能強弱而有不同，恕難-一評說，實非因為守密而不言也。
（二）生殖機能的反應：即在靜坐時，或剛剛下坐後，生殖器突然勃起，甚至久堅不下，猶如亢陽的狀態，同時引起睪九部分微細神經的跳動，以及攝護腺、會陰部分輕微的震動。在女性而言，有子宮震動或收縮以及兩乳房膨脹的現象。如依道家某些修煉丹道派的觀念，便認為它是一陽來復之機，正好採藥歸爐，用意引動呼吸作為搬運「河車」等的基礎，這種觀念是否正確，以後自有專論，在此暫略。但在靜坐的過程中，有了這種現象之後，如果不配合心理上的性慾衝動，那確是很好的情況。這是腦下垂腺、腎上腺與性腺等活動與興旺的證明，對於身體的健康，是絕對有益的現象。但是無論年齡老少、男女性別。一有這種現象發生，十個有九個半都會引發性慾的衝動。有了性慾的衝動，就會引發頭昏腦脹的感受。甚至，還有胸臆煩悶或發生情緒煩躁的感覺，非常難以排遣。如果因此而有了性行為之後，不但前功盡棄，而且還有過於性行為或手淫的損害，倘使不加上這些心理行為與性行為的破壞，那便有如老子所說嬰兒的狀況，「未知牝牡之合而朘作，精之至也。」它便會引發生命潛能而開始生機成長的作用。然而一般練一習一 靜坐的人，大都到此止步，極難過此一關，而且不知調整對治的方法，即使勉強壓制，久久亦成為病態，與忍精之害有同樣的毛病。如果練一習一 靜坐，做到絕對沒有這種現象發生，那麼，又等於生機斷絕，久而久之，便使身心枯寂無情，等於一潭死水。
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三十多年前，我有兩個練一習一 靜坐的朋友，有一位是中年人，他對我說：當他晚上和夫人一起對面靜坐時，碰到這種現象發生，睜眼一看夫人，比平時容貌更美，於是便順理成章，「只羨鴛鴦不羨仙」，進入凡夫的境界去了。另有一位是老年人，已經有六十多歲，有一次同在山中練一習一 靜坐，碰到這種現象，變成「亢陽不悔」的情況，想盡辦法，總難收拾，甚至利用冷水沐浴，也依然蛙怒如故。最後他只好下山回家，尋找「老妻畫紙為棋局」去了。朱熹說的：「世上無如人欲險，幾人到此誤平生。」其然乎！其不然乎！此二公的靜坐經歷，給予我後來的啟示，與專心一致尋求其中的癥結所在，實有多者。孔子說：三人行，必有我師焉。擇其善者而從之，其不善者而改之。」這話對於同參的道友而言，仍然具有聖人名言的無上權威。
關於靜坐中生殖機能反應的調整與對治的方法，也很繁複而一言難盡。如果真要專心致力於靜坐修道的人，最簡便而有效的方法就是減少飲食。甚至，可以短時不食，必定生效。佛教以過午不食為戒律的基本，並非完全屬於信仰的作用。諺云：「飽暖思淫慾，饑寒發盜心。」實在不是無因的。不過減食與不食煙火，也並不是簡單易行的事，如果不明其理而不知運用之妙，因此而害了胃病，則得不償失，不關我之言不在先也。