書生孔雪笠，是孔聖人的後裔，為人寬厚有涵養，善於作詩。他有位摯友在浙江天台當縣令，來信請他去。孔生應邀前往，而縣令恰恰去世了。他飄泊無依，窮困潦倒，回不了家，只好寄居在菩陀寺，被寺僧僱傭，抄錄經文。
菩陀寺西面百步開外，有單先生家的宅院。單先生是世家子弟，因為打了一場大官司，家境敗落，人口也少了，便遷移到鄉下居住，這座宅子於是空閒起來。有一天，大雪紛飛，道上靜悄悄的沒有行人。孔生偶然經過單家門口，看見一個少年從裡面出來，容貌美好，儀態風雅。少年看到孔生，便過來向他行禮，略致問候以後，就邀請他進家說話。孔生很喜歡他，非常高興地跟他進了門。見房屋雖然不太寬敞，但是處處懸著錦緞幃幔，牆壁上掛著許多古人的字畫。案頭上有一冊書，封面題名《瑯嬛瑣記》。他翻閱了一下，內容都是過去從未見過的。
孔生見少年住在這座宅院，以為他是單家的主人，也就不再問他的姓氏家族了。少年詳細地詢問了孔生的經歷，很同情他，勸他設館教書。孔生歎息道：「我這流落在外的人，誰能推薦我呢？」少年說：「如果不嫌棄我拙劣，我願意拜您為師。」孔生大喜，不敢當少年的老師，請他以朋友相待。便問少年說：「您家裡為什麼老關著大門？」少年回答道：「這是單家的宅子，以前因為單公子回鄉居住，所以空閒了很久。我姓皇甫，祖先住在陝西。因為家宅被野火燒了，暫且借居安頓在這裡。」孔生這才知道少年不是單家的主人。當晚，兩人談笑風生，非常高興，少年就留下孔生和他同床睡了。
第二天一大早，就有個小書僮進屋來生著了炭火。少年先起床進了內宅，孔生還圍著被子在床上坐著。書僮進來說：「太公來了。」孔生大驚，急忙起床。一位白髮老人進來，向孔生殷切地感謝說：「先生不嫌棄我那愚頑小子，願意教他唸書。他才初學讀書習字，請不要因為朋友的關係，而按同輩看待他。」說完後，送上一套錦緞衣服，一頂貂皮帽子，鞋和襪子各一雙。老人看孔生梳洗完了，於是吩咐上酒上菜。房內擺設的桌椅和人們穿著的衣裙光彩耀眼，不知道是什麼東西做成的。酒過數巡，老人起身告辭，提上枴杖走了。
吃完了飯，皇甫公子送上所學的功課，都是些古文詩詞，並無當時的八股文。孔生問他是何緣故，公子笑著回答說：「我不是為了求取功名。」到了傍晚，公子又擺上酒菜說道：「今夜盡情歡飲，明天便不允許這樣了。」又喊書僮說：「看看太公睡了沒有？如果睡了，可悄悄把香奴叫來。」書僮去不久，先用繡囊把琵琶帶了回來。過了片刻，一個侍女進來，身穿紅裝，艷麗無比。公子讓她彈奏《湘妃》曲，香奴用象牙撥子勾動琴弦，旋律激揚哀烈，節拍不像以前所聽到的。又讓她用大杯斟酒，二人一直喝到三更天才罷。
第二天，兩人早起一同讀書。公子非常聰慧，過目成誦。兩三個月後，下筆成文，令人驚歎叫絕。他們約好每五天飲酒一次，每次飲酒必定叫香奴來陪。一天晚上，喝到半醉的時候，孔生的兩隻眼睛緊緊地盯住了香奴。公子已經明白了他的心意，說：「這個侍女是老父親撫養的。您離家既遠又無妻室，我替您日夜籌劃已經很久了，想為您找一位美貌的妻子。」孔生說：「假若真要幫我的忙，必須找一個像香奴這樣的。」公子笑著說：「您真正成了『少見而多怪』的人了，要是認為香奴漂亮的話，那您的心願也太容易滿足了。」
過了半年多，孔生想到郊野去遊玩，到了大門口，見兩扇門板外邊上著鎖，便問公子是什麼原因，公子說：「家父恐怕結交一些朋友擾亂心緒，所以閉門謝客。」孔生聽說後也就安下心來。
當時正值盛夏濕熱季節，他們便把書房移到園亭中。孔生的胸膛上突然腫起一個像桃樣的瘡癤，過了一夜竟然長得像碗一樣大了，他疼痛難忍，呻吟不止。公子朝夕探望，連吃飯睡覺都顧不上。又過了幾天，孔生痛得更加厲害，漸漸不能吃喝了。太公也來探望，父子相對歎息。公子說：「我前天夜裡考慮，先生的病情，只有嬌娜妹妹能冶療。已派人到外祖母家去叫她了，怎麼這麼久還沒到來？」話剛說完，書僮進來說道：「娜姑到了，姨婆和松姑也一同來了。」父子倆急忙進了內宅。一霎時，公子領著妹妹嬌娜來看孔生。嬌娜年約十三四歲，美艷聰慧，窈窕多姿。孔生一見到她的美貌，頓時忘記了呻吟，精神也為之一爽。公子便對妹妹說：「這是我的好朋友，我們不亞於同胞兄弟，妹妹要好好為他醫治。」嬌娜於是收起自己的羞容，垂著長袖，靠在床上為孔生診斷病情。手把手之間，孔生聞到嬌娜身上散發著的芳香勝於蘭花。嬌娜笑著說：「應該得這種病，心脈都動了。病情雖然危急，但是還可醫治；只是皮膚瘡塊已經凝結，非割皮削肉不可。」說完就脫下手臂上的金鐲安放到孔生的患處，慢慢壓了下去。瘡癤突起一寸多，高出金鐲以外，而瘡根的紅腫部位，都被收在鐲內，不像以前如碗那樣大了。嬌娜又用另一隻手掀起衣襟，解下佩刀，刀刃比紙還薄。她一手按鐲一手握刀，輕輕沿著瘡根割去。紫血順著刀流出來，沾染了床席。孔生貪戀嬌娜的美姿，不僅不覺得疼痛，反而還怕早早割完，沒法再和她多偎傍一會兒。不多時，把瘡上的爛肉都割了下來，圓團團的就像樹上削下來的瘤子。嬌娜又叫拿水來，把割開的傷口洗淨。然後從嘴裡吐出一粒紅丸，像彈丸一樣大小，放到割去了瘡癤的肉上，用手按著它旋轉。才轉了一圈，孔生就覺得熱火蒸騰；再一圈，便覺得習習發癢；轉完三圈，已是渾身清涼，透入骨髓。嬌娜收起紅丸放回嘴裡，說：「治好了！」說完便快步走了。孔生一躍起身追出門外感謝，覺得長時間的病痛像是一下子全沒了。而心裡卻掛念苦想著嬌娜的美貌，再也無法控制自己。
從此孔生閉卷呆坐，百無聊賴。公子已經看出他的心事，說：「我為您物色了很久，終於選得一位好姑娘。」孔生問：「是誰呀？」公子回答說：「也是我的親屬。」孔生苦想了好長時間，只是說：「不必要了。」然後面對牆壁吟誦元稹的詩句道：「曾經滄海難為水，除卻巫山不是雲。」公子領會了他的意思。說：「家父仰慕您的大才，常想聯為婚姻。只是我僅有一個小妹嬌娜，年齡又太小。我還有個姨表姐阿松，已十八歲了，長相不俗。如果不信的話，松表姐天天都來遊園亭，您等候在前廂房，可以望見她。」孔生便按公子說的到了那裡，果然見嬌娜和一個美人一起來了。這女子畫眉彎如蠶蛾的觸鬚，纖瘦的小腳穿著鳳頭繡鞋，與嬌娜難分上下。孔生大喜，便求公子作媒。
第二天公子從內宅出來，向孔生祝賀說：「事情辦好了。」於是清掃另一個院子，為孔生舉行婚禮。這天夜裡，鼓樂齊鳴，熱鬧異常。孔生覺得好似月亮中的仙女忽然來和他同衾而臥，竟然懷疑廣寒宮殿即在眼前。未必在雲霄之上了。結婚之後，孔生心裡非常滿足。
一天夜裡，公子對孔生說：「您對我增長學問的指點我永遠不會忘懷。只是最近單公子解除官司回來，索要宅子很急。我家想要離開此地西去。看樣子已很難再相聚，因而離情別緒攪得心裡非常難受。」孔生願意跟隨他家西行。公子勸他還是回山東故鄉，孔生感到很為難。公子說：「不用憂慮，可立即送您走。」
不多時，太公領著松娘來到，拿出一百兩黃金贈送給孔生。公子伸出兩手緊握著孔生夫婦的手，叮囑二人閉上眼睛不要看。他們飄然騰空，只覺得耳邊的風聲呼呼地響。過了很久，公子說：「到了。」孔生睜開眼，見果然回到了家鄉。這才知道公子並非人類。他高興地叫開家門。母親出乎意料，又看到漂亮的兒媳，全家都非常喜悅。等到回頭一看，公子早已無影無蹤了。松娘侍奉婆母很孝順，她的美貌和賢惠的名聲，傳誦遠近。
後來孔生考中了進士，被授予延安府司理官職，攜帶著家眷上任了。他的母親因為路遠沒一同去。松娘生了個男孩，取名叫小宦。孔生後來因冒犯了御史行台而被罷官，受阻回不了家鄉。有一次他偶然到郊外打獵，碰見了一位美貌少年，騎著匹黑馬駒，頻頻回頭看他，孔生仔細看了看，原來是皇甫公子。急忙收韁勒馬，兩人相認，悲喜交加。公子邀請孔生跟他一起回家去。他們走到一村，樹木茂密，濃蔭蔽日。進了公子家，見門上飾有金色的泡釘，彷彿世族大家。孔生問嬌娜妹子的近況，知道她已經出嫁了；又知岳母也已去世，非常感慨傷心。他住了一宿回去，又和妻子一同返回來。這時，正好嬌娜也來了，她抱過孔生的兒子上下拋逗著玩，說：「姐姐亂了我家的種了。」孔生拜謝她先前的恩德，嬌娜笑道：「姐夫顯貴了，瘡口已經好了，沒忘記疼吧？」她的丈夫吳郎，也來拜見。在這裡住了兩夜才離去。
一天，皇甫公子忽帶憂愁的神色，對孔生說道：「天降災禍，您能相救嗎？」孔生雖然不知將要發生什麼事，但卻立即表示自己甘願承當。公子急忙出去，招呼全家人來到，排列在堂上向孔生禮拜。孔生大為驚異，急問緣故。公子說：「我們不是人類，而是狐狸。今有雷霆劫難，您願意以身抵擋，我們就都能生存；不然的話，請您抱著孩子走吧，免得讓您受牽累。」孔生發誓與公子全家共存亡。於是公子讓孔生手執利劍站立在門口，叮囑他說：「霹靂轟擊，也不要動！」孔生按公子說的去辦。果然見陰雲密佈，白晝如夜，昏天黑地。回頭一看住過的地方，寬大的房舍沒有了，只有一座高大的墳塚，有個深不見底的大洞穴。正在驚異不定的時候，霹靂一聲巨響，震撼山嶽；狂風暴雨驟起，把老樹都連根拔出。孔生雖然感到耳聾眼花，卻依然屹立在那裡一動不動。在濃煙黑霧之中，忽見有個鬼樣的怪物，尖嘴長爪，從深洞中抓出一個人來，隨著煙霧上升。孔生瞥了一眼那人的衣裳鞋子，覺得很像嬌娜。急忙一躍而起，用利劍向怪物剌去，隨手墮落一物。突然又一個炸雷爆裂，孔生被震倒在地，竟然昏死過去。
過了一會兒，天晴雲散，嬌娜自己慢慢甦醒過來。當她看到孔生死在身旁，便大哭著說道：「孔郎為我而死，我為什麼還活著！」松娘也從洞內出來，一起把孔生抬了回去。嬌娜讓松娘捧著孔生的頭，讓公子用金簪撥開孔生的牙齒；她自己兩手撮著孔生的腮，用舌頭把口裡的紅丸送到他的嘴裡，又口對口地往裡吹氣。紅丸隨著氣進入孔生的喉嚨，發出格格的響聲。不一會兒，孔生竟甦醒過來。見親屬們都在面前，彷彿如夢中醒來。於是一家團圓，不再驚慌，萬分喜悅。
孔生認為墓穴不可久住，提議讓大家和他一同回自己的故鄉。滿屋的人都交口稱讚，只有嬌娜不高興。孔生請她與吳郎一起去，嬌娜又怕公婆不肯離開幼子，一整天也沒商量出結果。忽然見吳家的一個小僕人，汗流滿面氣喘吁吁地來到。大家驚慌地再三追問他，才知道吳郎家也在同一天遭難，全家都死了。嬌娜聽說，頓足悲傷，啼哭不止。大家一起慰勸她。直到這時，大家一同隨孔生回歸故鄉的計劃才算定下來。孔生進城料理了幾天，回來就連夜催促整理行裝。
孔生回到家鄉後，把自己的一處閒棄的園子給皇甫公子一家住，平常反鎖著園門；只有孔生和松娘來到，才開門。孔生與公子、嬌娜兄妹在一起，下棋、飲酒、談天、聚會，親密得就像一家人。孔生的兒子小宦長大了，容貌美好，有狐狸的神情。他到城裡去遊玩，人們都知道他是狐狸生的兒子。