邢雲飛是河北順天府人，喜歡玩賞石頭，見到形態特別優美的玩石，自己從不惜代價收買。一次，偶然到河中打魚，水中有一塊東西把網掛住了。他潛伏到水底把它撈上來，一看，是塊尺把長的方石頭，四面玲瓏剔透，峰巒疊起，秀美異常。邢雲飛非常高興，如同得到了無價的珍寶。帶到家中，用紫檀木雕了一個底座，把石頭安在上邊。陳設在桌子上。每當天將下雨的時候，石頭的每一個細孔中，都有雲煙生出，遠處觀望，如同在上面塞了白色的棉絮。
一個有權勢的土豪，來到邢雲飛家中，要求觀看一下石頭；他一見到石頭，就把石頭遞到健僕手中，策馬揚鞭而去。邢雲飛無可奈何，只有頓足悲憤罷了。那僕人扛著石頭走到河邊，將石頭放在橋上休息，忽然失手，石頭掉到河中。土豪憤怒地用鞭子抽打僕人，馬上出錢僱傭善長水性的人，到水中打撈。但是，他們想盡一切辦法，到處搜尋，始終沒有見到。最後，只好貼了一個願出重金懸賞打撈石頭的約書，就走了。自此以後，到水中打撈石頭的人，每天都把河擠滿了，最終仍然沒有一個人得到。後來，邢雲飛來到石頭掉落的地方，望著滔滔的河水嗚咽悲泣。只見河水清澈見底，而石頭仍然還在水中。邢雲飛大喜，脫去衣服躍入水中，抱著石頭從河底浮出，把它帶回家，再不敢將石頭擺放在客廳中，就另打掃一間清潔的屋子，把石頭陳設在那裡。
一天，忽然來了一位老頭敲門，要求看一看石頭，邢雲飛假托說石頭已經丟失了。老頭笑著說：「客廳裡陳設著的不是嗎？」邢雲飛便把他請到客廳裡，以證實確是丟失了。等到老頭子與邢雲飛走到客廳裡，那塊石頭果然陳沒在客廳的几案上。邢雲飛驚愕地說不上話來。老頭子用手撫摸著石頭說：「這是我家的舊物，丟失了已經很久了，今天才知道它原來在這裡。我既然找到了，那就請你歸還我吧！」邢雲飛很窘迫，便與老頭子爭論誰是石頭的真正主人。老頭子笑道：「既然是你家的東西，有什麼驗證？」邢雲飛回答不上來。老頭笑說：「我本來就識得，此石前後共有九十二個孔竅。那個大孔中有五個字，是：『清虛天石供』」邢雲飛細細審視，果然如同老頭說的，孔竅中刻有小字，細如粟粒。只有仔細看，才能辨認清楚；又數它的孔竅，也像老頭子說的那樣。邢雲飛沒有話說，只是執意不給。老頭笑著說：「誰家的東西，憑你來作主啊。」拱拱手便走了。邢雲飛把他送出門去；回到屋裡一看，石頭不見了，大吃一驚。心疑是老頭干的，急忙去追趕老頭。而老頭在慢慢地走著，還未走遠。跑上前去拉著他的袖子苦苦哀求。老頭說：「奇怪啊！那麼一塊大石頭，能用手握著藏到袖子裡嗎？」邢雲飛知道老頭子是神人，強拉著他回來，跪在他面前請求還給他。老頭就問：「這塊石頭，究竟是你家的，還是我家的？」邢雲飛說：「確實是屬先生你的，但我求先生割愛啊！」老頭說：「既然是這樣，那麼石頭本來就在這裡。」邢雲飛進到內室，則石頭仍然放在那裡。老頭說：「天下的寶物，應該給與那些真正愛惜的人。這塊石頭能自己選擇主人，老漢我也高興啊。然而這塊石頭急於自我顯露，他出世過早，而惡劫的運氣還未消除。我確實是想把它帶走，等三年後再奉贈你。但是，既然你一定想留下，應當減少你三年的壽數，這樣這塊石頭才能自始至終與你相伴，你願意嗎？」邢雲飛說：「願意。」老頭於是用手指捏石頭的孔竅，石竅像泥一樣軟，隨手閉塞。老頭捏閉三竅，說：「石頭上的孔竅數，也就是你的壽數。」老頭子欲去，邢雲飛苦苦地挽留他，但老頭堅決辭別；邢雲飛問他姓字，他也不說，就去了。
時間過了一年，邢雲飛因為有事出門去，夜間有小偷到他的房問，別的什麼東西也沒丟失，惟獨把那塊石頭偷了去。邢雲飛回來，見石頭丟失，悲痛傷心得要死。他到處訪察、購求，但沒有一點蹤影和頭緒。又過了幾年，偶然到報國寺去，見到有賣石頭的，走近一看，就是自己丟失的那塊石頭，邢雲飛準備認走自己的石頭。但賣石頭的很不服，因而扛著石頭告到官府。官府問：「你有什麼證據啊？」賣石頭的能說清楚石頭上的孔竅數。邢又問賣石頭的其它特徵，卻茫茫然說不出來了。邢雲飛尋於是說明這石頭竅中的五個字及三個孔竅被捏閉的指痕。邢雲飛的情理，得到伸張。當官的於是想以棍杖責打賣石頭的人，賣石頭的人解釋說，這是他用二十兩銀子在集市上買來的，這才把他放了。邢雲飛得到石頭後，用錦帛把石頭包裹起來，藏在木櫃子中，偶爾觀賞，必先燒香以後才拿出來。
有一位尚書，想花百兩銀子的價格購買邢雲飛的石頭。但邢雲飛回答：「就是萬兩黃金也不賣。」尚書很生氣，就藉故其它的事，陷害邢雲飛，把他關在監獄裡。為了把邢雲飛救出來，家裡人便典賣田產。尚書於是托人傳話給邢雲飛的兒子，兒子又把情況告訴了邢雲飛，邢雲飛寧願以死殉石，也決不給這個尚書。邢雲飛的妻子於是與他的兒子偷偷商量，把石頭獻給了這個尚書。邢雲飛出獄以後才知道這件事，他罵妻子打兒子，屢次想自殺，都被家人覺察而未死成。一天，夜間，邢雲飛夢見一偉丈夫來，自稱是：「石清虛。」告訴邢說：「不要難過。我只不過與君分別年餘。明年八月二十日清晨，可到崇文門，用兩貫錢就可贖回來。」邢雲飛得到這個夢示後，很高興，特別記住這個日子。再說那塊石頭到尚書家以後，再也沒有孔竅出煙霧的靈異，時間一久，尚書也就不以此石為珍貴。第二年，這位尚書以獲罪而被削職，接著就死了。邢雲飛按期到崇文門，尚書家中人把石頭偷出來，正在尋找買主，邢雲飛見了用兩貫錢買了回來。
後來，邢雲飛八十九歲了，就自己準備好送葬的壽材、壽衣，又囑咐自己的兒子，必定用這塊石頭殉葬。不久，邢雲飛果然死了，他兒子就遵照他生前遺囑，把石頭給埋到墳裡。大概過了半年時間，小偷把墳墓挖開，把石頭盜走了。邢雲飛的兒子知道了，但也無法去搜查尋找。過了二三天．邢雲飛的兒子攜帶著僕人走在路上，忽然見到兩個人，跌跌撞撞，滿頭大汗，對著天空自已認罪說：「邢先生，不要相逼，我二人把石頭拿去，不過賣了四兩銀子罷了。」邢雲飛的兒子便捉住兩個偷石者，送到官府，一審訊就伏罪了。問石頭哪裡去了，說已經賣給一位姓宮的了。把石頭取回來，長官玩弄著愛不釋手，竟想得到這塊石頭，命令把石頭寄存在官庫中。差役把石頭舉起，忽然石頭掉在地上，碎成幾十片，眾人無不失色。長官於是就用重刑處死了兩個偷盜石頭的賊。邢雲飛的兒子將石頭的碎片拾起，回去後，仍然埋到邢雲飛的墳裡。