卻說達瓦齊就俘後，清師奉旨凱旋，只留班第、鄂容安二人，帶了隨兵五百名，與阿睦撤納，辦理伊犁善後事宜。阿睦撤納移檄鄰部，諱言降清，陽稱清廷命他統領各番，來平此地；又暗囑黨羽四布流言，欲安准部，必須立阿睦撤納為大汗。班第鄂容安遣使密奏，乾隆帝亦付他密旨，令誘誅阿睦撤納。看官！你想阿睦撤納率眾西行，已似大魚縱壑，哪裡還肯來入網呢？況班第鄂容安，手下只有五百名隨兵，也不好冒昧舉事。接了朝旨，按住不發，惟促阿睦撤納入朝。阿睦撤納竟號召徒眾，來攻班第鄂容安。班第鄂容安且戰且走，馳了三百餘里，死的死，逃的逃，只剩了數十騎，番兵卻有數千追來，班第料不能脫，拔刀自刎，鄂容安也只得步他後塵了。這是乾隆帝害他。
是時定西將軍永常，已奉朝旨出駐木壘，聞報番兵大至，退兵巴裡坤，移糧哈密，因此阿睦撤納，聲焰愈盛。清廷逮回永常，命公爵策楞前代，玉保富德達爾黨阿為參贊，出巴裡坤進剿。玉保分軍先進，忽有番卒來報，阿睦撤納已由他部下諾爾布擒獻，玉保大喜，即向策楞處報捷。策楞也不辨真偽，飛章奏聞，不想過了數日，毫無影響。將軍參贊，先後馳至伊犁，阿睦撤納，已遠颺至哈薩克了。原來阿睦撤納聞大兵前進，恐不能敵，特差了番卒，馳到清營，假稱被擒，他卻望西遁去。策楞玉保中了他的緩兵計，到了伊犁，你怨我，我怨你，怨個不了，總歸無益。策楞玉保統是沒用人物，還虧阿睦撤納不用誘敵計，只用援兵計，尚得安抵伊犁。
乾隆帝聞知消息，復將策楞玉保革職。令達爾黨阿為將軍，飛速追剿，又命巴裡坤辦事大臣兆惠，為定邊右副將軍，出兵赴援，滿望旗開得勝，馬到成功。誰知達爾黨阿，到哈薩克邊界，又被阿睦撤納騙了一回，佯稱哈薩克汗願擒獻阿酋。往返馳使，仍無要領，額魯特三部新封台吉，反一律謀變，與阿睦撤納通同一氣。阿睦撤納間道馳還，大會諸部。這達爾黨阿還在哈薩克邊境，檄索罪人，正是可笑。只定邊右副將軍兆惠，率兵千五百人，已至伊犁，探得額爾特諸部，已皆叛亂，自知孤軍陷敵，不能久駐，忙領兵馳回。沿途一帶，統是敵壘，兆惠拚命衝突，走一路，殺一路，殺到烏魯木齊，刀也缺了，彈也完了，糧也盡了，可憐這等兵士，身無全衣，足無全襪，每日又沒有全餐，只宰些瘦駝疲馬，勉強充飢，正苦得了不得。老天又起風下雪，非常嚴冷，兆惠想遣人乞援，也不知何處有清兵，驛傳聲息，到處隔斷。忽聞番兵又踴躍前來，把烏魯木齊圍得鐵桶相似，兆惠泣向軍士道：「事已至此，看來我輩是不得活了。但死亦要死得合算，狠狠的殺它一場，方值得死哩。」軍士道：「大帥吩咐，安敢不從！但糧盡馬疲，奈何？」正在危急，忽東北角鼓聲喧天，有一支兵馬到來，兆惠登高一望，遙見清軍旗幟，不禁大喜，謝天謝地。番兵見援兵已到，不知有多少大兵，一聲吆喝，解圍而去。番眾實是無能。兆惠出寨迎接，乃是侍衛圖倫楚，因兆惠久無音信，率兵二千來探信息，無意中救了兆惠。兆惠與他握手進營，住了一日，便同回巴裡坤。當下飛書告急。
乾隆帝命逮達爾黨阿回京，授超勇親王策凌子成袞扎布，為定邊左副將軍，出北路，仍令兆惠出西路往剿。此次兆惠懲鑒前轍，挑選精騎，帶足糧草，誓師進發，決平叛寇。巧值綽羅斯部噶爾藏汗，被兄子噶爾布篡弒，噶爾布又被部下達瓦殺死。輝特和碩特兩部中，痘疫盛行，多半死亡，兆惠趁這機會，殺將過去，好像摧枯拉朽一般。番眾戰一陣，敗一陣，諸部酋長先後敗死，阿睦撤納又弄得倉皇失措，急急如喪家犬，漏網魚，仍竄至哈薩克。兆惠率兵窮追，到哈薩克界，哈薩克汗阿布賚，遣使至軍，願擒獻阿睦撤納。兆惠對來使道：「你主願擒獻阿逆，須於三日內繳到，過了三日，本將軍恰是不依，驅兵進攻，玉石俱焚，那時不要後悔！」來使唯唯而去。越二日，哈薩克又遣使到軍，報稱阿睦撤納，狡黠萬狀，我國正欲擒獻，不料被他走脫，逃入俄羅斯去了。現奉汗命，前來請罪，並貢獻方物，仰求大帥赦宥！」兆惠見他惶迫情狀，料知語言無欺，只得略加訓斥，命他回去。一面即飛奏清廷，由理藩院行文俄國，索交叛酋。後來俄國飭人搜捕，阿睦撤納已患痘身亡，只把屍首送交清吏。於是命成袞扎布歸鎮烏里雅蘇臺，留兆惠搜剿餘孽。自乾隆二十二年至二十五年，清兵先後追剿，自山谷僻壤及川河流域，沒一處不尋到，沒一處不搜滅，統計額魯特二十餘萬戶，出痘死的約四成，竄走俄羅斯哈薩克等處約二成，被清兵剿滅的約三成，還有一成編入蒙古籍，不過二萬戶，而且婦女充賞，丁壯為奴，額魯特遺民，自此寥落了。阿睦撤納料是絕大的掃帚星轉世。
准部既平，清廷乃畫疆分土，設官築城，駐防用滿兵，屯糧用旗兵，特簡任伊犁將軍，作了一個統轄的元帥。天山北路，方入清室版圖，免不得鐫碑勒石，旌德表功，費了幾個儒臣筆墨，成了幾篇煌煌大文，這也不消細說。
但乾隆帝得隴望蜀，平了准部，又想南服回疆。這回疆就在天山南路，與准部只隔一山，起初系元太祖次子察哈台領土，傳了數世，回教祖摩訶末子孫，由西而東，爭至天山南路，生齒漸蕃，喧客奪主，察哈台的後裔，反弄到沒有主權。因此天山南路，變作回疆。康熙時，噶爾丹強盛，舉兵南侵，把元裔諸汗，遷到伊犁，並將回教頭目阿布都實特，亦拘去幽禁。噶爾丹敗死，阿布都實特脫身歸清，聖祖賞他衣冠銀幣，遣官送到哈密，令還故地。阿布都實特死，其子瑪罕木特，想自立一部，不受準噶爾約束。策妄又遣兵入境，將瑪罕木特及他兩個兒子，統拿至伊犁，幽禁起來。及清將軍班第等到伊犁後，瑪罕木特已死，長子布那敦，次子霍集占，尚被拘縶。班第奏聞清廷，得旨釋布那敦歸葉爾羌，令他統轄舊部，留霍集佔居住伊犁，職掌教務。不到數月，阿睦撤納謀反，准部復亂，霍集占反率眾助逆，等到清副將軍兆惠，攻入伊犁，阿睦撤納西走，霍集占亦遁入回疆。兆惠剿平准部，奏遣副都統阿敏圖，南往招撫。
這個那布敦膽子頗小，願遵清朝指揮，偏偏胞弟霍集占，自北路遁歸，諫那布敦道：「我遠祖摩訶末，聲靈赫濯，天下聞名，傳到我輩子孫，反受人家壓制，真是惶愧萬分。現在准部已亡，強鄰消滅，不謀獨立，更待何時？」語頗不錯，可惜不度德，不量力。那布敦道：「清兵來攻，如何抵當？」霍集占道：「清軍新得准部，大勢未定，料他無暇進兵，就使率軍南來，我也可據險拒守，等他兵疲糧絕，逃去都來不及，怕他什麼？」那布敦尚在遲疑，霍集占又道：「哥哥若要降清，恐怕從今以後，世世要做奴僕過去，他要我的金錢，我只得將金銀奉去，他要我的妻子，我只得將妻子送去，他要我的頭顱，我也只得把頭顱獻去。我們兄弟兩人，還有安靜的日子麼？」我亦要問霍集占道，你不降清，金銀管得住麼？妻子守得牢麼？頭顱保得定麼？這叫做自去尋死。那布敦被他說得動心，遂依了阿弟的計畫，錯了，完了。便召集回眾，自立為巴圖爾汗，傳檄各城，戒嚴以待。
回戶數十萬眾，向來迷信宗教，因那布敦兄弟，的是摩訶末後裔，稱他為大小和卓木，和卓木三字，乃是回語，譯作漢文，便是聖裔的意義，至此得了聖裔的檄文，自然望風響應。只庫車城主鄂對，恐怕強弱不敵，率了黨羽，擬奔伊犁，途次與阿敏圖相遇，仍令回轉庫車，同去招撫。不料霍集占聞鄂對出走，已遣部下阿布都馳到庫車，把鄂對親族一一殺死，登陴固守。鄂對聞報，大哭一場，嗣與阿敏圖商議，請亟歸伊犁，添兵復仇。阿敏圖道：「我是奉命招撫，今不見叛眾，便想回去，叫我如何對將軍？」鄂對再三諫阻，阿敏圖只是不從，也是一個不識時務。且令鄂對先回伊犁。他只帶了百餘騎，馳到庫車，阿布都誘他入城，一陣亂剁，憑你阿敏圖如何忠誠，也入閻羅寶殿去了。清廷因兆惠剿撫准部，尚未竣事，別命都統雅爾哈善為靖逆將軍，率兵征回。雅爾哈善自吐魯番進攻庫車，大小和卓木引軍數千，越大戈壁來援，與清兵戰了兩次，都被打得落花流水，大小和卓木，退入城中；清兵乘勢圍攻，城堅難拔，提督馬得勝，募敢死兵六百名，暗掘地道，晝夜不息，將及城中，守兵聞地下隱有響聲，料是穿穴，便循途按索，到了城腳邊，掘下一洞，適通地道守兵，把草塞住，用火燃著，煙焰衝入穴中，可憐六百個清兵，不能進，不能退，都被燒得烏焦巴弓。好像竹管裡煨泥鰍。雅爾哈善經此大創，不敢力攻，大小和卓木乘機遁還，阿布都也率眾逃去。
清兵只得了一個空城，乾隆帝聞知大怒，飭將雅爾哈善馬得勝等，盡行正法，仍命兆惠移師南征。兆惠檄調各路兵，尚未到齊，因朝旨催促，即率步騎四千餘先進，過了天山，收復沙雅爾阿克蘇烏什等城，住阿克蘇城數日。後兵未至，兆惠性急如火，留副將軍富德駐阿克蘇，等待後軍，他竟帶了二、三千人，冒險前行。途中偵知大和卓木那布敦，在葉爾羌，小和卓木霍集佔在喀什噶爾，乃再分兵八百名，使副都統愛隆阿，遏住喀什噶爾援路，自率千餘騎，逕趨葉爾羌。葉爾羌城東有河，叫作葉爾羌河，亦稱黑水，兆惠兵少，不能進攻，便倚水立營。遙見葉爾羌城南駝馬往來，是個闊大的牧場，兆惠欲奪作軍用，逕命兵士渡河，河上本有木橋，清兵跨橋而過，橋未拆斷，誘敵可知。方過了四百騎，誰知橋下暗有伏兵，鐃鉤齊起，將木橋鉤斷，城中出回兵五千騎，前來邀擊。隔河清兵，不能相救，河西四百騎，哪裡當得住回兵？急忙棄了馬匹，鳧水逃回。貪小失大。回兵復搭好了橋，逾橋東來，後面又添了步兵萬人，張著兩翼，來圍清兵。兆惠左右衝突，馬中槍，再斃再易，總兵高天喜戰歿，參贊明瑞亦受傷，雖殺了番兵千名，究竟眾寡懸殊，支持不住，只得退入營中，趕緊築壘，準備固守。番兵亦築起長圍，四面攻打，槍炮如雨，幸虧清營靠著叢林，槍彈多飛入林中，清兵伐樹，得了鉛彈數萬枚，還擊回兵，又復掘井得水，掘窖得粟，賴以不睏。
兆惠遣了五卒，分路赴阿克蘇告急，又檄愛隆阿還軍阿克蘇，催援軍同至。愛隆阿未到阿克蘇，富德已接警報，忙率軍三千，冒雪赴援，到了呼拉瑪，距葉爾羌尚三百餘里，忽遇喀什噶爾回兵，截住去路，轉戰四晝夜，回兵越來越多，將富德軍圍住，接連數日，杳無援兵，富德急得了不得，一日，天氣昏黑，入夜尤甚，回兵各燃著火把，輪流進撲，富德連忙抵禦，拚命鏖鬥，突聞一片喊聲，自東而至，回兵紛紛倒退。富德乘勢殺出，火光中來了一員清將，乃是愛隆阿，富德大喜，即與愛隆阿合兵。愛隆阿道：「巴裡坤參贊阿公，亦到。」富德忙拍馬去會阿大臣，這位阿大臣，名叫阿里袞，他奉了廷旨，領兵六百名，解馬二千匹，駝一千頭，至阿克蘇，適值愛隆阿去催援軍，遂合軍前來，解了富德的圍。回兵在夜間不辨多少，四散潰遁。富德愛隆阿，與阿里袞兩下相見，欣喜過望，也不及休息，同趨葉爾羌。兆惠日望援軍，遙聞炮聲大作，料知援軍已至，即勒兵突圍，內外夾攻，殺敵千餘，毀了敵壘，同還阿克蘇。
過了冬，已是乾隆二十四年。阿克蘇已集清兵新舊軍凡三萬人，分道進行，兆惠由烏什攻喀什噶爾，富德由和闐攻葉爾羌，每路兵各萬五千，大小和卓木聞清兵大至，不敢迎敵，帶了妻孥僕從，並攜輜重，逾蔥嶺西遁，清兵奮勇追趕，到阿爾楚山，前面見有回眾，大半是老弱殘兵，富德料是誘敵，令明瑞阿桂為左翼，阿里袞巴祿為右翼，先據了左右二峰，然後富德領著中軍，從山口進去。進了山口，果然伏兵四起，那時清兵左右兩翼，從上殺下，把伏兵一齊殺退，追攻二十餘里，戮回兵無數，並斬他驍將阿布都，大小和卓木逃至巴達克山，大和卓木那布敦，挈了家眷先走，小和卓木霍集占，手下還有萬人，倚山為陣，率眾死戰。富德又分軍兩路，左右夾攻，用了大炮，向敵轟擊，霍集占不能支，逾山而遁，誰知前面山路逼促，又有輜重塞住，一時急走不脫；後面又被清軍追上，進退兩難。富德令降人鄂對等，豎起回纛，大呼招降，回眾情願投順，蔽山而下，聲如奔雷，霍集占忙奪路逃脫，偕那布敦急入巴達克山。巴達克山部酋，聞大小和卓木，擁眾而至，遣使探問，霍集占見了來使，命回報酋長，立刻親迎。來使出語不遜，霍集占拔出佩刀，把他斬首。窮蹙至此，還要妄為，真正該死。於是巴達克山部酋，興兵拒戰，和卓木兄弟，連妻孥舊僕，只有三四百人，被巴達克兵圍住，上天無路，入地無門，都束手就縛，個個被他擒去。巴達克部酋，為使臣報仇，將大小和卓木，一齊梟首，還想將他家屬，統行處死，適清使持到檄文，索獻罪犯，他樂得賣個人情，把大小和卓木的頭顱，及他家眷等，盡行繳出。金銀也丟了，妻子也拋了，頭顱也斷送了。富德命軍士押著回酋家屬，馳歸大營，與兆惠聯銜奏捷。乾隆帝命陝甘總督楊應琚，籌辦回疆善後事宜，兆惠等俱召還京師，遂封兆惠為一等公，加賞宗室公品級鞍轡，富德封一等候，並賞戴雙眼翎，參贊大臣阿里袞明瑞等，俱賞戴雙眼翎，又記起從前舒赫德的忠直，還他原職，其餘在事各官員，俱交部議敘。又做了幾篇平定回部的碑文，內外勒石，稱頌功德。
到次年二月，兆惠等奏凱還朝，乾隆帝親至良鄉，舉行郊勞典禮。兆惠富德等領隊到壇，格外嚴肅。乾隆帝下壇迎接，兆惠以下，都下馬見駕，叩首謝恩。乾隆帝親自扶起，說了許多慰勞話兒，遂一同登壇。乾隆帝升了御幄，當由軍士將大小和卓木家眷，推到壇前。這時乾隆帝龍目俯瞧，見有一位絕色婦女，也是兩手反綁，列入罪犯隊裡，乾隆帝不禁憐惜起來，便問道：「這是叛回的家眷麼？」兆惠應了聲「是。」乾隆帝道：「婦女無知，也遭此縲紲，瞧她情狀，很是可憐，朕擬一律赦宥。」兆惠忙道：「罪人不孥，乃是聖主仁政，皇上恩赦了她，她定然感激不淺。」拍馬屁的又到了。乾隆帝傳旨釋縛，眾回家眷，叩首謝恩，獨這絕色女子，雖是隨班俯伏，她口中恰絕不道謝。比眾不同。
郊勞禮畢，御駕還宮，立召和珅入見，和珅進內請安畢，乾隆帝問道：「朕見叛回眷屬中，有個絕色婦人，未知是誰？」和珅道：「待奴才探問的確，再來奏聞！」說畢，趨出，不一時又入大內，奏稱絕色婦人，乃是小和卓木霍集占的妃子，回人叫她香妃，因她身上有一種奇香，天然生成，所以有此佳號。」乾隆帝歎道：「朕做了天朝皇帝，不及那回部逆酋。」和珅道：「逆酋已死，這個佳人，被我軍拿來，聖上要如何處置，便作如何處置。據奴才想來，回酋的幸福，究竟不及我天朝皇帝哩。」乾隆帝道：「朕想把她叫入宮中，但恐外人談論，奈何？」和珅道：「罪婦為奴，本是我朝成例，今將香妃沒入掖廷，有何不可？」小人最喜逢君之惡。乾隆帝大喜，便命宮監四名，隨和珅去取香妃，好一歇，這三字乃從乾隆帝心中勘出。和珅已到，宮監導入香妃，玉容未近，芳氣先來，既不是花香，又不是粉香，別有一種奇芬異馥，沁人心脾。走近御座前，乾隆帝見她柳眉微蹙，杏臉含顰，益發動人憐愛。宮監叫她行禮，她卻全然不睬，只是淚眼瑩瑩。乾隆帝道：「她生長外域，未識中朝禮制，不必多事苛求。」便命宮監引入西苑，收拾一所寢宮，令她居住，並命宮監小心伺候。宮監已去，和珅亦退。次日，乾隆帝視朝畢，又召和珅入內，和珅見乾隆帝面帶愁容，暗暗驚異，只聽乾隆帝諭道：「香妃不從，如何是好？」和珅道：「她蒙恩特赦，又承聖上格外抬舉，如何不從？」乾隆帝道：「她口中說的回語，朕卻不能盡懂，幸宮中有個番女，頗諳回文，朕命她翻譯出來，據言：『國破君亡，情願一死。』朕亦不好強逼，你可有什麼計策？」和珅想了一會，便道：「從前豫親王多鐸，得了劉三季，起初也很是倔強，後來好好兒做了豫王福晉，和睦得了不得。應二十二回。婦人家大都如此，總教待得她好，她自然回心轉意。」乾隆帝道：「恐不容易。」和珅道：「她是做過回妃，一切飲食起居，統是回部格式，現若令她吃回式的菜蔬，穿回式的衣服，居回式的房屋，另擇回部老婦，伺候了她，不怕她不漸漸服從。」乾隆帝依了和珅的計策，凡香妃服食，概募回教徒供奉，又在西苑造起回式房屋，並築回教禮拜堂，選了數名老回婦，導香妃出入遊覽。怎奈香妃情鍾故主，淚灑深宮，一片貞心，始終不改。乾隆帝百計勸誘，她卻寂然漠然。有一日，被宮女苦勸不過，她竟取出一柄匕首來，刀光閃閃，冷氣逼人，宮女都嚇得倒躲。這事傳到慈寧宮，太后恐乾隆帝被害，趁著乾隆帝郊天，住宿齋所，竟傳旨宣召香妃，問她志趣。她只說了一個「死」字，太后遂勒令殉節。後人有詩詠香妃事道：
雛鬟生長大苑西，鈿合無情寶劍攜，
帝子不來花已落，紅顏黃土玉鉤迷。
香妃已死，乾隆帝尚未聞知，後來得了音耗，究竟傷感與否，容小子下回表明。
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阿睦撤納及大小和卓木，統不過脅惑徒眾，盜弄潢池，故卒為兆惠所殲滅耳。不然，兆惠一鹵莽武夫，只知猛進，動輒被圍，得一智勇兼全之敵帥，吾恐兆惠將為塞外鬼，安能生還玉門，昂然為座上公平？惟香妃以一被虜之婦人，臨以天子之尊威，始終不為所辱，凜節捐軀，臨難不苟，番邦中有是婦，愧煞世人多矣。
作者亟為表揚，可作彤史一則。