前面介紹了倉庫佈局，在庫區設計完成之後，需要將其錄入系統，並按照WMS系統規則為其編碼。由於庫位編碼規則與揀貨路徑選擇相關，佈局要按照WMS的揀貨路徑規則來編碼。
前文說過，倉庫中的庫區主要分為分揀區、存儲區、不良品存儲區、發貨暫存區、收貨暫存區。給每個庫區進行編碼（字母或數字）。庫位編碼和行列、樓層以及貨架號相關。例如庫位編碼A02-03-06可表示庫區A第2列第3層的第6行的庫位。
在系統中還需要定義庫區是立體庫區或是平面庫區、良品區或是不良品區、存儲區或是分揀區等類型。在新增庫位後，可以提供庫位條碼的打印功能。
在揀貨時需要用波次綁定揀貨車，當覆核完成之後再釋放。揀貨車的邏輯很簡單，需要界定揀貨車上的貨位數量（1、2、4、10等），揀貨波次包含的訂單數量不能大於揀貨車上的貨位數。
還有移庫操作，允許人工將某一庫位上的商品轉移到其他庫位上。
如果商品管理模塊需要查詢維護SKU與倉儲相關的信息，例如包裝、重量、外包裝等信息，應與商品中心打通，調用其數據。