成功的團隊有時也會面臨解散的危機，對於成員關係緊張的團隊來說更是如此。這樣的團隊需要一種特別的領導才可以團結起來——他們既能鼓舞士氣，又注重培養人才；在自身競爭力過硬的同時也懂得如何與人協作。肖克利顯然是與之完全相反的一種領導。從他獨自一人埋頭設計整流結晶體管的做法可以看出，即使是對待自己的同事，他也會表現得爭強好勝和諱莫如深。優秀團隊領導的另外一項技能是能夠向下屬灌輸一種不分上下級的團隊精神。肖克利也沒有這樣的能力。他是一個專制的領導，他經常對下屬的建議置之不理，這種做法會對團隊的士氣造成很大的打擊。布拉頓和巴丁之所以能夠取得如此重大的成就，是因為肖克利在那段時期只是向他們提出了一些意見，沒有對他們的工作進行過多的干涉。但是在此之後他變得更加獨斷專行了。
在週末打高爾夫球時，巴丁和布拉頓會互相傾訴自己對肖克利的不滿。有一天，布拉頓認為他們有必要將這個情況告訴貝爾實驗室的主管默文·凱利。「你想打電話給他嗎？還是讓我來？」他向巴丁問道。最後這項差事毫無疑問地落在了更加能言善道的布拉頓身上。
一天下午，他來到凱利位於肖特山附近的郊區的住處拜訪凱利，凱利在鑲木板的書房裡接見了布拉頓。布拉頓一五一十地說出了他們的不滿，以及身為主管和同事的肖克利是如何的不稱職。凱利只是隨意敷衍了這些怨言。「於是，我最後不經意地向他透露我和巴丁都清楚知道肖克利發明PNP（結）晶體管的時間，我也沒有想過這樣做會帶來什麼後果。」布拉頓回憶道。換句話說，他在無意間向凱利發出了一個含蓄的警告：在肖克利名下的整流結晶體管專利申請當中，有部分概念是來自布拉頓和巴丁之前的研究工作的。「凱利意識到如果我們雙方在未來出現了專利糾紛，我和巴丁都會如實交代我們知道的東西。這種想法徹底轉變了他的態度。從此之後，我在實驗室裡的地位得到了稍微的改善。」43 巴丁和布拉頓不再需要向肖克利匯報工作。
但是事實證明這項新的安排不足以令巴丁感到滿意。他當時的研究重點已經從半導體轉向了超導理論，他還接受了伊利諾伊大學提供的一份工作。「我的困境來自晶體管的發明，」他在交給凱利的辭職信中寫道，「在此之前，這裡擁有非常好的研究氛圍……但是在晶體管發明之後，肖克利開始阻撓小組內的其他成員涉足這個課題。簡而言之，他基本上只是利用這個小組來實現他自己的想法。」44
巴丁的離職和布拉頓的抱怨都對肖克利在貝爾實驗室的地位有所影響。他這種難以相處的性格意味著他已經與陞遷無緣。他曾經向凱利甚至是AT&T的總裁提出晉陞的要求，但是一直未能如願。「去你的，」他跟一位同事說道，「我要幹出一番屬於自己的事業，我將會成為百萬富翁，而且我要在加州實現這個目標。」在聽到肖克利的打算之後，凱利並沒有嘗試挽留他，反而鼓勵他這樣做：「我跟他說如果他覺得自己能賺到100萬的話，那就儘管去做吧。」凱利甚至打電話給勞倫斯·洛克菲勒（Laurence Rockerfeller），推薦他向肖克利正在醞釀的事業投資。45
1954年，肖克利在事業上尋求突破的同時還經歷了一場中年危機。在幫助妻子戰勝卵巢癌之後，他在妻子康復期間離開了她。他交了一位新的女友，後來還跟她結了婚。他還從貝爾實驗室休了長假。在這場典型的中年危機當中，他甚至給自己買了一輛新車——一輛綠色的捷豹XK120雙座敞篷跑車。
肖克利在加州理工學院做了一個學期的訪問教授，同時在位於華盛頓的美國陸軍武器系統評估小組擔任臨時顧問。然而，為了籌建自己的新公司，他在大部分時間裡都是在全國各地之間來回奔波——到不同的技術公司觀摩學習，以及拜訪包括威廉·休利特（William Hewlett）和埃德溫·蘭德（Edwin Land）在內的成功企業家。「我認為自己應該嘗試籌集一些資金，開創一番屬於自己的事業，」他向女友寫信道，「畢竟我顯然要比其他人更聰明，更有活力，而且更懂得人心。」他在1954年寫下的日記反映了他當時正在努力堅定自己創業的念頭。「缺乏上司的賞識意味著什麼？」他在日記中寫道。跟許多人物傳記的主題一樣，他還希望達到已故父親對自己的期望。在計劃如何創辦一家將晶體管普及到全世界的公司時，他寫下了這麼一句話：「這個一鳴驚人的想法會讓父親感到驕傲。」46
儘管肖克利後來一直都沒有取得事業上的成功，但他還是做到了「一鳴驚人」這點。他準備成立的公司會將一個種滿杏樹的山谷變成一個點硅成金的寶地。