1402年6月南京城的金川門緩緩打開，負責防守的谷王朱橞、曹國公李景隆迎接燕王朱棣的大軍進城，至此歷時三年多的「靖難」之役宣告結束，大明的皇位由朱標一脈轉移到了朱棣一脈。
最高權力面前絕沒有兄弟、叔侄之情，為了杜絕皇位的隱患，朱棣一上台開始了瘋狂的「斬草除根」行動，但耐人尋味的是「斬草」卻故意留了「根」。但與此同時朱棣還大肆修改前朝史書，修改、銷毀了大量文獻資料，所以我們只能從蛛絲馬跡中去尋索塵封的往事。
據記載朱標出生於1355年，1392年病死，是朱元璋的長子，雖然《明史》上說母親為馬皇后，但根據明人的記載，顯然情況並非如此，這裡不過多介紹。1371年已是皇太子的朱標娶常遇春之女為正妃，續娶呂氏為側妃。朱標一生有5子，除長子朱雄英早年夭折外，其他4子成了「靖難」後朱棣「斬草」行動的目標。
朱允熥（tēng）， 1378年出生，朱標的第3子。1395年朱允熥迎娶兵馬指揮趙思禮之女為妃；建文帝即位後，朱允熥被封為吳王，但並未到封地杭州就任。1402年6月朱棣攻佔南京後，將朱允熥由吳王（親王）貶為廣澤王，封國改在當時比較荒涼的漳州。
沒過多久厄運再次降臨，當年9月朱允熥被召到南京，以「弗知省躬，自生疑懟」（不知道反省，還心生怨恨）為罪名，將他削去王位，廢為庶人，囚禁於鳳陽高牆之內，稱為「吳庶人」。
即使囚禁起來，但朱棣對他依然不放心。1417年，蜀王的兒子崇陽王朱悅燇逃到長沙，谷王朱橞趁機準備利用朱悅燇，打著「建文君」的旗號意圖謀反，但被蜀王告發。朱棣吸取教訓，怕以後有人扶持朱允熥起事造反，於是不久後朱允熥暴死。
朱允熞（jiān），1385年出生，朱標第4子。建文帝即位後被封衡王，同樣未到封地就任。他的之後命運與朱允熥相似。朱棣進入南京後，先被降為懷恩王，居於建昌；9月與兄長一道被廢為庶人，禁錮於鳳陽。此後就沒有任何記載，但死於朱允熥之前。
如果說成年的朱允熥、朱允熞兄弟對朱棣還具有威脅，那麼未成年的朱允熙就太悲慘了。朱允熙生於1391年，是朱標最小的兒子。建文帝即位後，封他為徐王；隨著朱棣攻入南京，兩個長兄被廢為庶人，終身禁錮。朱棣似乎想為大哥朱標留下一脈，於是降封朱允熙為甌寧王，隨母親呂後居於懿文太子（朱標）陵園，以奉香火。
1406年2月朱允熙的府邸中莫名其妙的發生了一場特大火災，朱允熙在逃跑時跌倒在地，與母親呂後一起葬身熊熊火海。據文獻記載「四年二月邸中忽火起，驚仆地，卒年十六」。
作為建文帝的兄弟，朱允熥、朱允熞、朱允熙三人也只能算是「草」，建文帝一脈才是應該翦除的「根」。關於建文帝的下落，朱棣也派人明察暗訪幾十年，說法很多，關於這裡不做過多說明，主要說說他的後代。
根據清朝官方修的《明史》記載，建文帝有兩個兒子；但這並不準確，因為明人有不同的記載。先看已知的兩個。長子朱文奎，1396年出生，建文帝即位後冊立為皇太子，1402年靖難大軍入京，時年7歲的朱文奎與父親建文帝一起「莫知所終」。
另一個名叫朱文圭，朱棣佔領南京時，年方兩歲，此後也被禁錮與鳳陽的廣安宮中，號為「建庶人」。這一囚禁，人們似乎就忘記了它的存在。直到1457年明英宗朱祁鎮「奪門」復辟後，同樣飽嘗禁錮之苦的朱祁鎮動了惻隱之心，下令將已經囚禁了五十多年的「建庶人」釋放。
自孩提時朱文圭便被囚禁，從來沒有與外界接觸，甚至「不識牛馬」；也許不適應這種「新生活」，不久後朱文圭便病死。
其實除了上面這兩個外，建文帝至少還有一個兒子，他的排行應該介於前兩者之間。據明朝萬曆年間的狀元，有「焦太史」之稱的大文人焦竑記載，建文帝縱火後，宮內一片狼藉，明成祖朱棣進入南京皇宮巡視時，有一個小孩突然跪在他的面前，牽著他的衣服哭泣著說道：「孩兒餓矣，饑殺孩兒矣！」
此時朱棣心情應該是十分複雜的，這位歷經腥風血雨、殺人不眨眼的燕王竟然也流下了眼淚，說道：「汝生帝王家，有餓死理？」，隨即命人善加照看。其實孩子的話是老宮人教的，但天真無邪的孩子卻最終打動了老練狡猾的朱棣。
當然也有人說這個「牽衣者」就是朱文圭，但顯然不太符合，因為朱文圭是1401年出生，到1402年朱棣進京時，可能都不滿週歲，還處於呀呀學語的階段，又怎麼能在朱棣面前演戲呢？
此後這個「牽衣者」就被朱棣秘養於宮中，以至於後人已經不知道這是建文帝的第幾個兒子，以及他後來的事跡。那為何朱棣會斬草不而除「根」呢？
「本是同根生，相煎何太急」，朱棣讀書不多，但這個道理恐怕還是懂的。為了權力，同室操戈，這畢竟不是什麼光彩的事情，作為一個成功的篡逆者朱棣自然要將篡逆所帶來的負面影響將至最低，所以只是將朱標諸子、建文帝諸子囚禁，之後才一一除掉。退一步講，即使建文帝成功，恐怕也不會殺掉朱棣的。
其實朱棣將這個天真無邪的「牽衣者」秘養起來，正是為了保全這個侄孫。一方面讓這個孩子忘掉一切，做個普通人；另一方面他也不會對自己子孫後代的政權構成任何威脅。