公元1566年，即嘉靖四十五年，時為戶部雲南司主事的海瑞看不慣明世宗荒廢朝政，但問鬼神不問蒼生，各地官吏也投其所好，經常進奉一些所謂的祥瑞之類的東西，朝中也無人敢直言相勸阻，於是海瑞自備好了棺材，上書明世宗，其書名為《治安疏》，奏章寫的十分直接，口氣也十分嚴厲，不給皇帝留面子，指出了當時朝政的許多缺陷，明世宗勃然大怒，將海瑞打進錦衣衛大牢，「已下錦衣拷問」，估計海瑞吃了不少苦頭。刑部裁定應該判海瑞絞刑，「刑部擬絞」，但是明世宗似乎沒有下定決心，或許是嘉靖帝病了，同時主要是徐階壓住，刑部的文件一直沒有批下來。
就在這一年，嘉靖皇帝駕崩，隆慶皇帝登基，海瑞出獄。嘉靖皇帝臨終前也覺得不必殺海瑞。就在海瑞即將出獄的前夕，戶部司務何以尚覺得海瑞生還的希望很大，於是覺得必須做一個順水人情，上書請求赦免海瑞，嘉靖帝覺得此人根本就是來討巧的，大怒，將其打得死去活來，杖之一百，也下了大獄，「故上燭其奸，而深罪之」。
讓嘉靖惱火的還有一件事，何以尚明知道嘉靖皇帝病了，還大張旗鼓地用龍涎香為其祈禱求福，這兩件事湊起來，讓嘉靖覺得此人實在作秀得噁心，因此下大獄了都不給他好日子過，關在一個四面是釘子凸出，並且向裡面凸出的囚籠，人待在裡面，只要稍微一動，就會碰到釘子，「少一轉側，釘入其膚」，而且一天十二個時辰保持這種狀態。「十二時中但危坐如偶人。」
當時大家都以為何以尚死定了，沒想到這哥們生命力特強，關了那麼一陣，居然完整地活下來了，隨著嘉靖皇帝駕崩，海瑞被釋放，他也被釋放。大難不死，必有後福，海瑞後來一路官運亨通，何以尚也繼續當了二十多年官員，安然無恙地壽終正寢，還高壽。
這種晝夜用刑的囚籠，其專利擁有者據說是五代十國時期的福建人薛文傑，他將囚籠四面釘上裸露的釘子，都朝內，怎樣叫犯人不舒服就怎樣來，也是個極不厚道的傢伙。
不管怎麼樣，何以尚畢竟上書救過海瑞，海瑞多少得有點感恩之情吧。可是，何以尚後來降職南戶部郎，海瑞官居南少宰，二人見面時，何以尚要求與海瑞享受同等禮節，海瑞居然沒有答應，何以尚極其受傷，拂袖而出，海瑞也並不覺得內疚，從無半點歉疚的表示。二人都是硬脾氣，故而不能相容，「蓋二人俱負氣士也。」