崇禎帝是明朝末代皇帝，其一生有七個兒子，長大成人的只有三個。其中大兒子朱慈烺於崇禎三年(1630)，也即是他出生的第二年就被立為太子。
崇禎十七年(1644)，闖王李自成領導的農民起義軍進攻北京，崇禎帝見大勢已去，絕望地叫來太子朱慈烺並另外兩個兒子——朱慈燦、朱慈煥，親自為他們換上民間衣服，令其逃亡，並叮囑他們說：「見到做官的叫老爺或相公，見到平民百姓叫老爹或老兄，見到文人叫先生，見到軍人叫長官，以此保全性命，勿忘父母之仇，勿忘光復明室。」這是一位父親對不通人情世事的孩子們如何在亂世中安身立命的教誨，父子親情及無限感慨盡在其中。
後來，農民起義軍攻破城池，崇禎帝自縊煤山。由於局勢混亂，太子朱慈烺出宮後的下落便變得撲朔迷離起來，在當時就已經傳聞紛起。
其中第一種說法是，崇禎太子後被清廷處死。如《國壽錄·崇禎太子》和《甲申傳信錄》(作者錢粵只，明末清初人)中都有這樣的記載：
當時，太子趁亂逃出皇宮，被一位老太太收留。當老太太得知他是太子，便讓他隱姓埋名，在家藏匿三個月之久。後來老太太衣食無著，無力供養太子，就想辦法把太子送到了其親屬周奎家。這周奎膽小怕事，不敢收留，甚至聽到清廷的搜捕令後，立刻將朱慈烺上交了刑部。清朝統治者得到朱慈烺後，恐怕朱慈烺會成為明朝遺民的精神支柱，於是將他處死，斬草除根。
第二種說法是，被李自成俘獲。
《明史》記載：「京師陷，賊獲太子，偽封宋王。」
李自成進城後，受命保護皇子的太監怕受牽連，又見李自成下了懸賞令，便把太子獻給了李自成。李自成為了籠絡人心，將朱慈烺留在軍中，並將其作為招撫吳三桂的人質。
後來，李自成被吳三桂與清軍擊敗，他不得不與吳三桂議和，作為條件之一，把太子交給了吳三桂。後來太子逃出了吳三桂軍營，至於以後的行蹤，有人說太子被帶到了皇姑寺，也有人說太子死於亂軍之中，但還有人認為，李自成交給吳三桂的是假太子。
第三種說法是，出家為僧。
據廣東嘉應(今梅縣)地區的傳說，太子朱慈烺隨李自成西去途中，與當初的東宮侍讀李士淳一起逃走，到了嘉應州陰那山靈光寺削髮為僧。
辛亥革命後，李士淳的後人李大中在《二何先生事略》一文中公開宣稱其祖先曾救過崇禎太子，文中稱，李氏淳也曾想以太子為號召反清，但是隨著清軍席捲江南，大局已定，反清無望，太子只好絕望地剃度為僧，以了殘生。
還有人說，朱慈烺逃奔了南明小朝廷。
朱慈烺出宮後，顛沛流離、隱姓埋名，輾轉至南京弘光小朝廷。福王朱由崧召集大臣馬士英對他進行盤問，自然對答如流，很多人都認為是真的。可是福王為了穩定自己的帝位，拒不承認太子為真，有言太子為真的皆殺。後來清軍攻破南京，朱慈烺被擄，從此下落不明。
綜上所述，由於有關崇禎太子的記載出入很大，流傳下來的傳說又難辨真假，因此，時至今日，這位明朝末代太子的下落仍然是個謎團。
明朝末代皇帝的子女們下落之謎：崇禎迫周皇后自殺，又手刃妃、嬪、公主後，到萬歲山吊死在一顆槐樹上。明朝就此滅亡。但人們感到困惑不解的是：明朝末代皇帝的子女們哪兒去了？
明崇禎十七年(1644年)，闖王李自成在西安建立大順政權後，率領農民起義軍直搗北京。同年三月十六日包圍北京，開始發動猛攻。崇禎十七年三月十九日，崇禎皇帝見大勢已去，迫周皇后自殺，又手刃妃、嬪、公主後，到萬歲山(今景山)吊死在一顆槐樹上。明朝就此滅亡。與此同時，讓人們感到困惑不解的是明朝末代皇帝的子女們哪兒去了？
金庸先生曾在小說《鹿鼎記》中描繪的一位「白衣俠女纖塵不染，神功蓋世浪跡江湖」的尼姑形象。據說她乃是大明崇禎皇帝的公主長平，但這畢竟是小說故事。據《明史》記載：崇禎皇帝在皇宮中砍傷十六歲的長平公主後，長平公主暈死在血泊中，長平公主後來被人發現，抬到周皇后的父親周奎家中，五天後竟然甦醒過來。當她醒來的時候，北京城已經成了大順天下。周奎不敢收留她，就把她交給了李自成，李闖王見長公主居然死而復甦，感到很意外，於是將她交給劉宗敏救治。「大順」只在北京城裡呆了兩個月，就結束了它的歷史使命。李自成沒有來得及帶上長平公主，就在清軍的追擊下敗逃遠去。
清順治二年，長平公主向順治帝及攝政王多爾袞上書要求出家為尼，但清政府為了籠絡人心，不但不答應，在長平公主上書不久，順治帝就下達詔命：讓她與崇禎為她選定的駙馬周顯完婚，並且同時賜予府邸、金銀、車馬、田地。但僅僅過了幾個月，長平公主就病逝了，時為順治三年，長平公主十八歲。賜葬廣寧門外。
長平公主的下落有了結論，崇禎帝的兒子下落至今卻還是個謎。
據《明史·諸王傳》記載崇禎帝的一生共生有7個兒子。崇禎十七年(1644)，李自成攻陷北京之時，皇太子朱慈烺16歲，皇三子定王朱慈炯14歲，皇四子慈炤只有十歲。除了這三個兒子外，崇禎帝的其他的兒子都是早夭。李自成大軍攻破北京之日，崇禎帝為給大明保留一絲血脈。他讓兒子們都換上平民的衣服，由太監護送逃出北京城。臨死，他還寫下遺詔，要求各地的官員協力輔佐太子，重振大明。
那麼，崇禎帝的這些兒子們逃到哪裡去了呢？
說法一：被清廷捕獲殺害。持這種說法的人認為在李自成戰敗後，太子趁機逃脫，被吳三桂部下捕獲，後來太子又逃到外舅周奎家，周奎擔心私藏太子會惹來禍端，就將太子獻給了清攝政王多爾袞，經過一番辨認，最終被害。這一觀點依據《石匾書後集》中的《烈帝本紀》及《太子本紀》記載，《國壽錄·崇禎太子》及《甲申傳信錄》等書中也有比較類似的記述。這些說法都認為太子最終被清廷抓獲，然後遇害。
說法二：被吳三桂殺害。《明史紀事本末》中稱，李自成攻下北京城後，太子慈娘與定王慈炯、永王慈招一起被起義軍所擄獲。後來，李自成不敵戰敗，就與吳三桂議和，吳三桂提出用歸還太子與二王並離開北京城為條件，換取停戰。李自成同意了，就將太子等人交給了吳三桂。這樣說來，太子就落人了吳三桂的手中。據此，有人提出，太子已經遇害。
說法三：跟隨李自成敗退，不知所終。崇禎兒子三人等在北京陷落後，均未逃脫，一併為李自成軍俘獲。在對他們的處理上，李自成採納李巖等人的建議，封明太子為宋王，永王和定王也改封他爵。後來，吳三桂在山海關反叛，李自成率軍親征時，身邊還帶著明太子及兄弟，其用意自然是以此來堵住吳三桂效忠明廷之借口，並招降吳三桂。但此舉並沒有收到效果。李自成農民軍與吳三桂交戰受挫，決定離京西撤時，將他們三兄弟一起帶走。從此太子便杳無音信，不知死活。這種說法是依據《明史紀事本末》、《明季遺聞》以及《明史》等，如《明史紀事本末》云：「京城被攻陷，李自成捕獲太子，封為宋王。當李自成向西前進時，太子卻不知所終。」《明季遺聞》的記述尤為具體：「李自成軍受挫後，便狼狽回到京城，之後又向西行。有人說太子和二王也一同出行。」《明季遺聞》乃鄒流綺父子所編輯，他們在甲申之變時都身臨其境，且該書面世之時離事情發生之日不過十年左右，因此人們認為他倆所輯錄的遺聞還是較為可靠的。
說法四：跟隨李自成敗退，後逃出做了和尚。有人認為在李自成軍隊敗退北京的路上，劉宗敏受了重傷，放鬆了對他的看管，他就找了個機會和他以前的老師李士淳從闖王的軍中逃了出來，後來到了李士淳的老家廣東嘉應州陰那山出家當了和尚。他們在人跡罕至的深山裡建了一座寺廟叫做「聖壽寺」，大殿就取名叫「紫極殿」，處處都顯示了寺中和尚的神秘出身。據說太子死後，廟裡就開始供奉一尊「太子菩薩」的神位。這尊神位始終保留著，直到辛亥革命後，清王朝覆滅了，人們才知道原來供奉的這尊塑像就是明朝的逃亡太子。李士淳的後人也聲稱他們的先祖確實在亂軍之中救了太子，並把太子帶回自己的家鄉，兩人還一同出家做了和尚。
除了以上四種說法外《明季太略·太子一案》中則說，太子從李自成軍隊逃出後，被人帶到皇姑寺藏了起來，又和太監高起一起潛逃到天津，然後像傳言中的建文帝一樣，出海南下，不知所終。《野史無文》則記載太子曾逃往南京的南明小朝廷，清兵攻陷南京後，他被人獻出後被帶往北方，不知所終。還有的說，明末清初兵荒馬亂的，太子後來死於亂軍之中。但這些說法均無證據證實。
種種說法，不一而足，清康熙時期有人借崇禎太子之名舉行反清起義，牽連並死了很多人，結果也被證實是假的。崇禎的三個兒子到底下落何處，到今天仍是解不開的謎團。