獻公對兩位公子的不辭而別十分惱怒，認為他們果真有謀反的意圖，便發兵進行討伐。他首先攻打蒲邑，由於獻公的軍隊人數眾多，蒲邑很快就陷入了重重保衛之中。蒲邑人宦官寺人披催促重耳趕快自殺謝罪。重耳沒有這麼做，而是越牆逃跑了。寺人披緊追不捨，情急之下砍斷了重耳的衣袖。重耳巧妙地穿過晉軍的包圍圈，最終逃到了翟國，依靠了他的母家人。此後，獻公又派兵討伐屈邑，夷吾率領屈邑人堅守抵抗，晉軍最終也沒能攻下屈邑。
幾年以後，獻公派遣大夫賈華率軍再次討伐屈邑，由於晉軍實力過於強大，屈邑最終失守。夷吾無處安身，便也打算逃往翟國去找重耳。他的隨從冀芮說：「公子您不能這樣做啊，重耳已經在那裡了。現在您如果再前去，晉國一定會興兵討伐翟國。翟國害怕晉國，到時災禍必然會降臨在您的頭上。您不如逃往梁國。梁國靠近秦國，秦國勢力強大。獻公去世後，您就可以請求秦國幫助自己回國繼位。」夷吾聽從了他的建議，於是逃到了梁國。兩年以後，為了獲取重耳，晉國出兵討伐翟國。翟國國君因為與重耳有親戚關係，便出兵攻打晉國的嚙桑，晉軍只好停止討伐而回國。此後，隨著獻公的年紀一天天增大，便漸漸地淡忘了過去的嫌隙，再也沒有追究重耳和夷吾。
借道伐虞
獻公二十二年，晉國再次向虞國借道來討伐虢國。虞國的大夫宮之奇勸諫虞國國君說：「大王，您千萬不能把道路借給晉國，如果那樣做我國就要面臨滅頂之災。」虞君說：「愛卿你多慮了，晉國國君與我是同姓，怎麼會討伐我呢？」宮之奇見他不聽，便具體解釋道：「太伯和虞仲，都是太王的兒子。太伯逃走了，因此沒有繼承君位。虢仲、虢叔，都是王季的兒子、文王的卿士，他們功勳卓著，這些都收藏在保存盟書的府庫裡。晉君與虞君、虢君都是同姓，而且細究起來，他與虢君的親緣關係比虞國更近，現在晉國既然連虢國都想滅掉，又怎麼會愛惜虞國呢？難道虞國與晉國的關係，能比桓叔、莊伯與晉君的關係更密切嗎？桓叔、莊伯的家族有什麼罪，獻公把他們全部滅絕了。可見虢國和虞國的關係，就好比嘴唇與牙齒一樣，嘴唇沒有了，牙齒也就失去了依靠，不會安然無恙地存活了！」
虞公沒有聽從宮之奇的話，最終還是答應了晉國的請求。宮之奇知道虞國早晚會被晉國滅亡，為了避免災禍，他便率領自己的家族離開了虞國。這年冬天，晉國滅亡了虢國，虢公丑被迫逃到了周京。晉軍得勝歸來，軍心高漲，在班師回國的路上，又順便襲滅了虞國，俘虜了虞公和他的大夫井伯、百里奚。獻公把他們作為自己女兒的陪嫁，送到了秦國。他還派專人主持虞國境內山川之神的祭祀。大臣荀息把此前用來賄賂虞公的屈地出產的名馬牽了回來，奉還給獻公。獻公笑著說：「馬還是我的馬，就是齒齡老啦！」虞公不聽從宮之奇的勸告，最終做了亡國之君。
荀息的誓言
一年多以後，獻公得病了，而且病得很重，他擔心自己死後國家會發生動亂，就對大臣荀息說：「我的時日已經不多了，我想要立奚奇為太子，但是他太年紀太小，我擔心諸位大臣不服從而造成國家的內亂。您能夠擁護他嗎？」荀息流著淚回答說：「大王，您放心吧，我一定會盡心盡力地輔佐奚奇，決不會辜負您的厚望！」於是獻公將奚奇托付給荀息，並任命他為丞相，主持國家的政事。
獻公去世以後，晉國的大臣裡克、呸鄭想迎接重耳回國繼位。他們要暗中利用申生、重耳、夷吾三位公子在國內的黨羽進行作亂，便對荀息說：「奚奇的三個冤家將要發難，他們外有秦國的幫助，內有國人的支持，您將怎麼去應對啊？」荀息回答說：「無論如何，我是不會辜負先君的重托的。」
幾天之後，裡克派人在為獻公守喪的地方殺死了奚奇。這時獻公還沒有下葬。荀息感到自己辜負了獻公的囑托，於是想要自殺來謝罪。但是有人建議他說：「你死了又有什麼用呢？又有什麼臉面去見先君，還不如擁立奚奇的弟弟悼子為王，然後繼續輔佐他。這樣還可以使先君的心得到少許安慰。」荀息聽從了這個人的建議，就擁立悼子做了國君。一個月以後，在上朝的時候，裡克派人將悼子連同荀息一起殺死了。君子們聽說了荀息的事跡，讚歎道：「《詩經》裡所說的『白圭上的斑點還可以磨去；話說錯了是不可以挽救的呀』。這話好像說的就是荀息啊！他沒有違背自己的誓言。」