陳寶應是晉安侯官人，世代都是閩中四大姓之一。父親陳羽，很有才幹，是郡內豪傑，寶應的性格反覆多變，詭計很多。梁朝時晉安郡屢次背叛朝廷，殺害郡守，陳羽都是先煽動造反，後來又領著官兵來鎮壓，靠這樣逐漸總攬了一郡兵權。侯景作亂時，晉安太守賓化侯蕭雲把郡守位置讓給陳羽，陳羽年老，便只主持日常事務，讓寶應領兵。當時東部鬧饑荒，會稽更厲害，十有七八都被餓死，而只有晉安衣食豐足，兵力強盛。
侯景被平定後，元帝便委任陳羽為晉安太守。武帝陳霸先輔政，陳羽請求告老還鄉，把郡守傳給寶應，武帝答應。紹泰二年(556)，封寶應為侯官縣侯。陳武帝代梁後，委任他為閩州刺史，兼任會稽太守。文帝即位，加封他父親為光祿大夫，又命宗正記錄他家世系，編入皇帝宗室。
寶應娶留異女兒為妻，侯安都討伐留異時，寶應派兵幫助留異，又資助周迪兵士和糧食，出兵侵犯臨川。都督章昭達破周迪之後，文帝又命他討伐寶應，下詔讓宗正把他的家族從皇室除名。寶應盤據建安湖邊抗拒昭達，昭達深溝高壘不與他交戰，只讓人造筏子，不久河裡漲水，昭達借助水勢放排，突破寶應水柵。寶應軍潰敗。他被抓到建康，在大街上斬首。