賀婁子干字萬壽，本是代地人。
隨西魏南遷，世代居住必右。
祖父賀婁道成，任西魏侍中、太子太傅。
父親賀婁景賢，任右衛大將軍。
子干小時以驍勇出名。
周武帝時，他開始作官，任司水上士，被稱為強幹有才。
累次陞遷，到任小司水。
因他勤勞，封為思安縣子爵。
不久授他使持節、儀同大將軍。
大象初年，兼任軍器監，繼而授為秦州刺史，晉爵位為伯爵。
到尉遲迥造反作亂時，賀婁子干與宇文司錄隨從韋孝寬討伐叛軍。
遇上賊人包圍了懷州，子干與宇文述等人打敗了叛軍。
高祖很高興，親自寫信說：「叛賊尉遲迥，膽敢派遣叛軍，作亂於懷州。
你受命誅討，應運蕩滌反賊，我聽此喜訊，讚賞不已，欣喜之情，不可言喻。
大丈夫富貴的日子，正在今天。
望你善建功名，以不辜負朝廷的希望。」子幹此後每次作戰，必先登城。
到打破鄴城時，與崔弘度追趕尉遲迥到樓上。
子干升任上開府，封為武川縣公，食邑三千戶。
另以思安縣伯爵的爵位，封他的兒子賀婁皎。
開皇元年(581)，子干晉爵位為巨鹿郡公。
這年，吐谷渾進犯涼州，子干以行軍總管身份隨上柱國元諧打擊吐谷渾，子干功勞最大，皇上下詔書褒獎。
高祖擔心邊塞不安，就令子干鎮守涼州。
次年，突厥進犯蘭州，子干率部抵抗，到了可洛賅山，與突厥軍相遇。
賊人很多，子干守河流以為軍營，突厥軍幾天喝不到水，人馬很疲憊，子干縱兵進擊，大破突厥軍。
朝廷於是策授子干為上大將軍，說：「啊呀呀！你聽我的命令。
只有你才能賢明，意志堅毅果敢，你當武將，功績我有所耳聞。
往年那些凶丑不安寧，屢屢驚動疆場。
你開拓疆土，平定亂軍，功勞很大。
因此根據獎賞典冊，增加你的車服，提高你的官階。
去執行我的命令吧，你恭敬地接受這光榮的典冊，能不謹慎謙虛嗎？」調他當營建新都的副監，不久授他為工部尚書。
這年，突厥人又進犯邊塞，他以行軍總管身份，隨竇榮定反擊他們。
子干從另一條路打敗突厥軍，斬首一千多級。
高祖嘉獎他，派通事舍人曹威送去詔書，慰勞、勉勵他。
子干請求入朝，有詔讓他沿驛道來見。
這時吐谷渾又進犯邊疆，西方多遭其害。
皇上命子干去討伐。
子干沿驛道到了黃河以北，調發了五個州的兵卒，到吐谷渾國去搶掠，殺了他們的男女一萬多人，二十天後回還。
高祖因隴西頻頻被侵犯搶掠，很擔擾。
那裡的風俗不設村子，高祖命令子干率領百姓築城堡，修田地，積贊糧食，以防備不測。
子幹上書說：「這裡凶寇侵擾，我蕩滅他們的日子，不是早晨就是晚上，請聖上不要擔擾。
現在我在這裡，需要見機行事，不能完全按詔書辦事。
而且隴右、河北，地廣人少，邊境未安寧，不可能廣泛地種田。
我看屯田的地方，收穫少而花費多，白花人力，最後還是被入侵者糟蹋。
屯田諸事，請都廢除。
但隴右百姓以放牧為生，如再聚居，他們會更加不安。
只能嚴密偵探，豈容他們聚集人馬？請讓我在重要路口，加強防備。
只要鎮守之所相連接，烽火能夠相望，百姓雖然散居，也沒什麼可擔心的。」高祖聽了他的。
不久，胡人侵犯岷州、洮州二州，子干統兵趕去，賊人聞訊逃走。
高祖因子干通曉邊疆的事情，授他榆關總管十鎮諸軍事。
過了一年多，授他雲州刺史，很為胡人懼怕。
幾年後，突厥的雍閭派人來請求投降，並獻羊馬。
有詔以子干為行軍總管，出西北道接應他。
回來後，授子干為雲州總管，把突厥人所貢獻的馬百匹、羊千隻賜給他，於是下詔書說：「自從你把守北大門，那裡風塵不驚。
突厥所貢獻的羊馬，還是賜給你。」因母喪離職。
朝廷因榆關是重鎮，非子干鎮守不可，不久就要他出來管事。
開皇十四年(594)，子干因病在任上去世，時年六十歲。
高祖傷心歎惜很久，賜他縑采千匹，米麥千斛，追贈他為懷州、魏州等四州刺史。
謚號叫「懷」。
他兒子賀婁善柱繼承爵祿，官至黔安太守。