朱修之字恭祖，義陽平氏人，曾祖朱燾，晉朝平西將軍，祖父朱序，晉朝豫州刺史，父朱諶，晉朝益州刺史。
朱修之從州主簿遷任司徒從事中郎，文帝對他說：「你的曾祖們當年做王導丞相中郎，你現在又做王弘的從事中郎，你可以說是不屈辱你的祖先了。」後來隨著到彥之北伐。到彥之從河南回來，留下朱修之鎮守滑台城，被魏軍包圍，幾月之中糧食吃盡，將士們薰出老鼠吃掉它們，最終滑台被魏軍攻克。當初，修之的母親聽說朱修之長時間被敵人包圍，經常擔心他，突然有一天他母親的乳汁因驚動而噴出，他母親哭著告訴家裡人說：「我現在已老了，忽然有乳汁，這是不吉祥的，我的兒大概是陷入不幸了。」之後，消息傳來，修之果然在這日落入敵人之手。
拓跋燾很欣賞他為國保持節操品格，讓他當侍中，把閨中的公主嫁給他。朱修之暗地設法回到南方，他的妻子懷疑他，每次流著淚問他的打算，朱修之很為她的真情感動，但還是沒有告訴她。之後鮮卑族人馮弘自稱燕王，以黃龍城為首都。拓跋燾進攻他，朱修之和同時陷入魏國的邢懷明同時隨從進攻的魏軍。有一個叫徐卓的人，又想率領南國那些被俘虜的暗地起事，事情暴露而被殺。朱修之、邢懷明因此恐懼而跑到馮弘那裡，馮弘不尊重他們。在馮弘處留了一年。碰到宋國使者下詔書到了馮弘的國家。朱修之官職一貫較高，傳遞詔書的人見到他便給他作揖。燕人一向敬重傳遞詔書的人，看到他對朱修之很恭敬，才開始對朱修之禮貌一些。當時魏國多次進攻馮弘，有人勸說馮弘派朱修之回到南方求救，於是修之被派回到南朝。渡海到東萊，遇到大風折斷了船桅，用長繩子吊著船帆，船才重新正常。撐船的人看見了飛鳥，知道快靠岸了，不久便到了東萊。
元嘉九年(432)，朱修之到了京師，朝廷讓他當黃門侍郎，多次陞官一直到江夏內史。雍州刺史劉道產死時，群蠻造反。朱修之此時當征西司馬，討伐蠻人失敗了。孝武初年，當寧蠻校尉，雍州刺史，加任都督。朱修之為政寬宏而簡明，士兵和百姓非常擁護他。當荊州刺史譙郡王劉義宣造反，下書來時，朱修之與他一同造反。朱修之假裝和他同反，暗中則派人向孝武帝表示效忠。孝武帝肯定了他，讓他當荊州刺史，加上都督的職務。劉義宣因朱修之不和他一齊造反，於是讓魯秀當雍州刺史，叫他進攻襄陽。朱修之命令部下截斷馬鞭山的道路。魯秀不能過去，於是退兵。當劉義宣梁山失敗時，單個人坐著船向南逃跑。朱修之率領軍隊向南平定殘敵。當時竺超民攔住劉義宣，朱修之到了，便砍掉了劉義宣的腦袋，朱修之因這功而封爵南昌縣侯。
朱修之生活儉樸，凡是賞賜贈予的東西，一點也沒有接受。有俸祿，有時接受，但馬上和部下賭博，終究不裝入自己的腰包，只把鎮撫人民安定各處蠻人當成主要事情。不久被調為左民尚書，再換領軍將軍，離開雍州時，公私財物一點也不侵犯，計算他在雍州燒的油和用的牛馬谷草，用私人的錢財十六萬還給當地官民。然而他性格太過節儉而近似刻薄，他姐姐在鄉間窮得無衣無食難以過活，朱修之從未給一點照顧。有一次看他姐姐，他姐姐想刺激他，為他做了菜羹粗飯，朱修之說：「這是窮人家的好飯菜。」並且吃得很飽而離去。先前新野人庾彥達當益州刺史，帶著姐姐上任，分出自己俸祿的一半供養他姐姐，四川人非常稱讚他。
朱修之後來從車上掉下來折斷了腿，他辭去尚書職務，只任崇憲太僕，照樣加上特進，金紫光祿大夫。因為腳痛不能單個人行走，皇上特別為他安排一個扶持的人。死了，贈官侍中，特進照舊。謚號貞侯。