再把目光轉向益州，說說蜀漢。
劉備在白帝城駕崩前對他的喪事也做了專門交代，劉備要求凡事要以國事為重，因為一舉一動都會影響大局，所以喪事一律從簡，喪期不能超過三天，三天之後一切都要恢復常態，各郡國的太守、國相、都尉以及縣令也照此執行。劉備之所以強調喪期，是因為古制有服喪三年的說法，後來雖然服不了三年的喪，但對喪事也會看得極重，程序煩瑣，時間拖得很長，影響到正常的生產和生活。曹操臨終前留下遺詔，要求葬禮結束便脫去喪服，喪期縮得更短。
被劉備生前任命為尚書令的李嚴也趕到了永安，之後李嚴出任中都護，留鎮永安，諸葛亮奉劉備的靈柩返回成都。
李嚴的這個官職很重要，中都護相當於總護軍，護軍一職設於漢光武帝時，與直接帶兵的將軍不同，他們的職責是對將軍進行監督，職權也很大。李嚴作為蜀漢各級護軍的總統領，這項重要的人事安排可能是兩位托孤大臣碰面後商定的，也可能和尚書令一樣都是劉備生前的安排。
章武三年（223）5月，諸葛亮一行回到成都。
成都正處在動盪不安之中，不久前發生的黃元叛亂事件一度攻擊到了離成都僅百餘里的地方，人心擾攘、謠言紛紛，在此情況下諸葛亮認為太子必須馬上登基，以穩定局面。
拜見完太子後，諸葛亮以托孤大臣的身份立刻安排登基典禮。就在本月，劉禪在成都繼皇帝位，後世習慣將劉備稱為先主，而將劉禪稱為後主。後主下詔，大赦，改年號為建興，三個月後先帝劉備被安葬於惠陵。
後主登基後封諸葛亮為武鄉侯，此前諸葛亮並無爵位，這次受封的武鄉侯有人認為是鄉侯，但其實在諸葛亮故鄉琅邪國有一個武鄉縣，古人封爵習慣以在其家鄉地或附近選擇食邑，符合這種情況，所以這個爵位是個縣侯，後世稱諸葛亮為武侯。
後主劉禪下詔，命諸葛亮仍任丞相，同時兼任益州牧、司隸校尉，另一位托孤大臣李嚴被封為都鄉侯，和諸葛亮一樣都假節，仍擔任中都護，駐紮在永安，同時兼任九卿之一的光祿勳卿。趙雲升任為征南將軍，兼任中護軍，掌管中央禁軍，此前禁軍一直由吳太后的哥哥吳壹掌握，同時封趙雲為永昌亭侯。向寵擔任中部督，協助趙雲典宿衛兵，被封為都亭侯。鎮北將軍魏延職務未變，只是封爵位為都亭侯。
封固陵郡太守劉琰為都鄉侯，升任九卿之一的衛尉，班位僅次於李嚴。劉琰在後世名氣並不大，他是劉備擔任豫州刺史時就開始追隨的老人，有他這樣資歷的人已經不多了，因為和劉備同姓，經劉備親自考證還是同宗，所以格外親待。在平息黃元叛亂中楊洪立下大功，被賜爵為關內侯，任命他為忠節將軍，鑒於他的才幹，為加強蜀郡的管理，重新讓他兼任蜀郡太守。
職務有變動的還有：向朗升任步兵校尉，尹默、杜瓊被拜為諫議大夫，杜瓊後來還擔任大鴻臚卿、太常卿，來敏擔任虎賁中郎將。
以上是蜀漢主要人事變動情況，此輪人事調整涉及的人員並不多，諸葛亮的想法可能是先保持政治上的穩定，因為先帝駕崩之後蜀漢內外的環境一點都不容樂觀，當務之急還是處理好這些麻煩事，人事安排盡量往後放一放。
對蜀漢來說，當時最大的麻煩來自益州南部幾個郡的叛亂。
益州南部是一片廣闊的區域，其中的牂牁郡、益州郡、越巂郡和永昌郡又稱南中，這四個郡範圍很大，大體相當於今雲南、貴州兩省以及四川省西南的一部分，這裡遠離成都，遍佈高山大河，雜居著各少數民族部落，統治相對薄弱。
劉備在時曾派鄧方前往南中，任命他為安遠將軍，力圖鞏固那裡的統治基礎。鄧方很有本事，他以少御多，震懾有方，確保了南中一帶沒有發生大的禍亂。
章武二年（222）鄧方去世，劉備問時任益州別駕的李恢誰可以接任鄧方，李恢自告奮勇，毛遂自薦，劉備嘉許，派他接任鄧方。當時，夷陵之戰已經開打，劉備無力增兵南中，全靠李恢維持。李恢也很有本事，雖然兵力單薄，境內也發生了幾次小規模的叛亂，但都被他平定了。
劉備兵敗駕崩的消息傳來，南中沸騰，平時就有二心的人紛紛躍躍欲試。先是越巂郡叟人頭領高定元起兵反叛，殺了蜀漢任命的郡將焦璜，舉郡稱王。緊接著，益州郡有人鬧事，殺了太守正昂，公然反叛。
諸葛亮接到報告後十分憂慮，現在大規模用兵南中條件並不成熟，因為南中問題由來已久，而且問題十分複雜，如果不做好準備倉促用兵，要麼失利，要麼雖有小勝卻不能解決根本問題。
司金中郎將張裔對益州本地事務很熟悉，遇到棘手的事情諸葛亮常徵詢他的意見，對益州郡的叛亂張裔也認為應該安撫，諸葛亮便上報後主同意，任命張裔為益州郡太守，去南中穩定局勢。
正昂被殺後，益州郡的大姓雍闓在當地很有勢力和威望，益州郡的事務都由他在周旋，張裔到達後，不知道雍闓其實已暗中投靠了孫吳，還找他協助自己。雍闓把張裔抓了起來，送到孫吳，公開叛蜀。
雍闓一夥編造謠言說，朝廷向南中征要貢品，其中有烏黑的狗300只，連胸前的毛都得是黑的；蟒蛇的腦汁3斗；長3丈以上的斫木3000根。純黑色的狗還能辦好，蟒蛇的腦袋一向很小，3斗腦汁得多少條蛇？斫木很少有能長到2丈高的，3丈的木頭極罕見，要3000根哪裡弄去？
這些謠言水平並不高，但很有煽動性，南中到處人心惶惶。就在這焦頭爛額之際，又發生了越巂郡太守朱褒舉郡響應雍闓的事件。記載，益州從事常房按規定到下面檢查工作，常房早就聽說朱褒將有異志，就把朱褒的主簿抓起來審問，後來把他殺了。朱褒大怒，攻殺常房，誣其謀反。
諸葛亮當然知道誰是誰非，但常房做事也太魯莽，不看現在是什麼時候，激起了朱褒的反叛。為了安撫朱褒，諸葛亮不惜下令誅殺常房之子，並把他四●個弟弟流放到越巂郡。
有史學家對諸葛亮的做法很有意見，他認為常房是冤枉的，諸葛亮應有所覺察，哪裡有妄殺無辜來安撫奸人的道理？但發議論是容易的，而面對現實需要的是更周全的考慮，但鑒於當時的局勢，諸葛亮需要隱忍。
諸葛亮知道李嚴長期擔任犍為郡太守，瞭解南中的情況，在當地也有一定威望，就請他給雍闓寫信，希望雍闓回頭是岸。李嚴前後給雍闓寫了六封信，曉之以利害，雍闓只回復了一封信，信中說：「聽說天上沒有兩個太陽，地上沒有兩個君王，現在可好，稱帝的就有三家，所以我們這些遠在偏僻之地的人心裡充滿了惶惑，也不知道該怎麼辦。」
話裡充滿了挑釁和傲慢，眼看整個南中都將喪失，幸好還有人頑強抵抗和堅守。雍闓等人進攻永昌郡時，太守呂凱和郡丞王伉堅決抵抗，雍闓無法得手。呂凱字季平，永昌郡本地人。永昌郡住著一批姓呂的人，他們是呂不韋的後代，當年秦始皇殺呂不韋，徙其子弟宗族到蜀漢，後漢武帝在西南夷置郡縣，又把這些呂氏後人遷居於此，當地甚至還有一個不韋縣。
呂凱和王伉發動本地士民堅決抵抗雍闓一夥的進攻，把他們拒之境外。雍闓多次寫信給呂凱勸降，被呂凱嚴詞拒絕。呂凱在本郡頗有威恩，大家同心協力，雍闓竟然無法踏入永昌郡一步。
呂凱獨保永昌，讓諸葛亮鬆了口氣，只要呂凱能堅持一年半載，就能為他贏得富裕的時間，只有做好了充分準備，才能發起南中之戰。
後主登基，南中叛亂，外部也不安寧。
劉備駕崩的消息傳到曹魏那邊，有人認為自關羽死在荊州以來，張飛、馬超、許靖、黃忠、劉備等人先後離開人間，蜀漢的柱石一根接一根地倒下了，見過大風大浪的人物只剩下了諸葛亮一人，他能否獨自撐起這座大廈，令人懷疑。
於是有人給曹丕出了個主意，鑒於蜀漢目前的狀況應該勸說他們效仿孫吳稱臣，曹丕同意，讓手下的大臣們給蜀漢丞相諸葛亮寫信，勸諸葛亮等人去掉不該有的帝號，接受曹魏的封賞。寫信的人很多，有曹魏的司徒華歆、司空王朗、尚書令陳群、太史令許芝、謁者僕射諸葛璋等。華歆、王朗不僅是曹魏的重臣，而且是天下名士，很有影響力；許芝是太史令，既然拿天命說事，自然少不了他；諸葛璋的職務不高，也讓他出面給諸葛亮寫信，推測起來，他很可能是諸葛亮的本家。
給諸葛亮寫信的人裡還有陳群，除身居要職外，他給諸葛亮寫信還有一段淵源，早年劉備擔任豫州刺史曾辟陳群為別駕，二人有過共事的經歷。
這些勸降信像雪片一樣飛來，讓諸葛亮陷入了沉思，他對天下大勢早有成熟的看法，也做出了清晰的規劃，多年來他一直為之而奮鬥，眼前雖然遇到了一些挫折，但對他這樣志向遠大且堅定的人來說，這些都算不了什麼，他不會改變心中的理想和蜀漢既定的國策，更何況興復漢室也是先帝臨終前的殷殷囑托。
但對手發起了輿論戰，如果不應戰就會失分，諸葛亮決定予以正面回應，以此向外界特別是曹魏表明立場，這個立場既是他自己的，也代表了蜀漢。
諸葛亮沒有給他們一一回信，而是在深思熟慮之後寫了一篇名為《正義》的文章，這篇文章寫得很精彩，從回顧歷史入手，舉了項羽、王莽和劉秀的例子與當今的局勢做對照，從正、反兩面說明暫時實力大小不足以決定未來，堅守正義的蜀漢一定能取得最後的勝利。
這篇文章既是對曹魏勸降者的一個公開回復，同時也統一了蜀漢內部的思想。先帝駕崩，朝野上下動盪不安，益州政壇本身就很複雜，各種不同出身和背景的人懷著不同的想法，有的希望蜀漢政權繼續發展壯大，有的則信心不足、對是否能渡過難關懷有疑慮，有的人甚至蠢蠢欲動，只要能保住自己的利益，誰來主持大局對他們來說無所謂。面對如此複雜的形勢，只有先把內部思想統一起來，才能做到行動上的統一。
諸葛亮用這篇文章向內外鄭重表明，蜀漢絕不可能投降，先主所制定和追求的興復漢室、統一天下的目標不會放棄，而且只要上下團結一心，一定能取得最後的勝利。
勸降不成功，曹丕又有了一個想法。
對付蜀漢曹丕手裡還有一張牌，那就是蜀漢降將黃權，曹丕把他找來，要他出任益州刺史，專門對付蜀漢。
劉備的死訊傳到洛陽，群臣都來向曹丕致賀，但黃權卻沒有來，曹丕知道黃權的心意，但有意嚇唬嚇唬他。曹丕派人詔黃權進見，黃權還沒有到，曹丕一次次派人去催，給人感覺很著急，黃權的侍從下人聞訊無不震悚，認為曹丕發怒了，一定會出大事，但黃權鎮定自若。
曹丕只是惡搞，他很欣賞黃權的才能和為人，他現在設了一個益州刺史，治所設在南郡曹魏的控制區，利用黃權的影響力分化瓦解蜀漢，黃權雖然不情願，但也只能聽命。
這樣，荊州境內就有了兩個「益州政府」，一個是孫權控制下的益州牧劉璋；一個是曹丕控制下的益州刺史黃權。由於他們在益州都有一定的影響力，所以不能小看他們的作用，荊州本來還有不少人忠於蜀漢，有人還設法發動武裝叛亂以策應蜀漢，但都沒有成功，與這兩個「政府」的作用密不可分。
劉璋不久去世了，孫、劉之間關係也不斷緩和，但孫權仍不放棄這種做法，他任命劉璋的次子劉闡為益州刺史，讓他到交州與益州交界處組成「政府」。
黃權雖然接受了曹丕的任命，但內心裡一直沒有把蜀漢當作敵人，後來魏明帝繼位，對黃權的政治態度並不放心，曾當面問黃權：「現在天下三分，應該以哪個為正統？」黃權不願違心，回答說：「應該以天文為正統。」
遇到不想回答的問題總會說「今天天氣真好啊」，黃權的回答類似於此，魏明帝大概對這個回答並不滿意，讓黃權做具體解釋，哪知黃權說得還有鼻子有眼：「前面出現了『熒惑守心』的天象，結果文皇帝駕崩，而吳、蜀二主都平安無事，這就是它的驗證。」回答得很巧妙，雖然表示了屈服，但仍從正面避開了誰是正統的話題。司馬懿也很器重黃權，曾經問黃權蜀國像他這樣的人才有多少。
司馬懿在給諸葛亮的一封信裡說：「黃權是個爽快人，經常從座位上起身讚歎著談論您，這種談論總不離口。」黃權後來在曹魏病逝，去世前的官位是車騎將軍，雖是一個虛職，但也顯示出曹丕父子二人對他的重視。黃權死時身邊有兒子黃邕相陪，他的另一個兒子黃崇一直在蜀漢為官，蜀漢滅亡時隨諸葛亮的兒子諸葛瞻戰死於綿竹。