澎湖群島位於台灣海峽上，東距台灣本島約50千米，西離中國大陸約140千米，總面積約為128平方千米，向來是扼守中國東南海上通道的重鎮，早在唐朝末年就有許多漁民世代居於島上，中國最晚在南宋時期已派兵在澎湖駐守〔樓鑰《攻愧集》卷88泉州知府《汪大猷行狀》記載：乾道七年（1171）四月，起知泉州，到郡……郡實臨海，中有沙洲數萬畝，號平湖……」即澎湖的最早官方記錄。文章中並記錄汪大猷為保護在平湖的漢人不被毗捨耶人（台灣少數民族）劫掠，在平湖造屋200間遣將駐守。〕。16世紀，葡萄牙人航行到此，稱澎湖為「漁翁島」，之後荷蘭東印度公司兩度企圖在澎湖建立貿易根據地，但遭明朝驅離。鄭成功從荷蘭人手中光復台灣後，也在澎湖設置安撫司，清代則改設巡檢司。
甲午戰爭後，澎湖隨台灣割讓給日本，離開中國版圖。日據時期，殖民政府看重澎湖群島與馬公港的軍事特性，設置澎湖島廳，並於1897年改稱「澎湖廳」。之後在港口制高點建造一座要塞型建築，1937年，日本在馬公城北牆（現民福路以東）險要之地修築一座供海軍將領與貴族落腳的貴賓館，取代原先位於馬公港畔，較為喧鬧的松島紀念館。
不過由於地勢瓦解、險要盡失，日據政府澎湖廳總務課於1940年改在今日馬公市西側介壽路觀音亭附近眺望極佳之地，設計興建日式木造的第一賓館；適逢對日抗戰爆發，建築材料採購和運輸困難重重，直到1943年2月才竣工，主要作為招待日本皇族及高級軍官處所。事實上，當地本是一片墓地，甚至近日還發現清朝同治年間古墓，之所以這麼急著改建，主要還是因為地勢足以監控馬公港與吼門海道，戰略意義重大。由於戰事吃緊，日本皇族也根本未曾前來貴賓館落腳。台灣光復後，貴賓館由國民政府接管，並於1946年改稱「第一賓館」，並修復木製地板，未大幅更動格局，以方便要員入住。只是沒想到，就在這段國共內戰正酣的時刻，澎湖第一賓館意外登上政治舞台。
◆地下作戰指揮室入口
1958 年「八二三」炮戰期間，蔣中正及蔣經國進駐澎湖第一賓館，並興建地下指揮中心，藉以指揮前線戰事，這也是蔣介石眾多行館中唯一一個具有戰略設施且「參與」實際戰爭任務的行館。指揮中心建於賓館西側，入口隱蔽，牆壁厚實，此扇鐵門具有軍艦門的相同規格，並配備防彈及抽風設備，似有刀槍不入、毒氣不侵的能力。蔣介石曾坐鎮其中，執行「閃電」「鴻運」「轟雷」計劃。（上圖）
◆通往地下指揮室的通道
進入地下指揮中心的入口，還有一段長長的通道，順著階梯而下，才又到達下一個鐵門，可見設計之用心，防備之謹慎。現如今澎湖第一賓館已向公眾開放，地下指揮中心也不再擔任作戰的指揮場所。狹長的通道與昏黃的燈光，還有重重鐵門，讓人身處其中就感受到一種神秘、緊張的氣氛。（下圖）
◆賓館內部設計
日據時期的諸多建築風格都採用洋和混合的式樣，第一賓館亦不例外。賓館內部的空間格局分為待客之用的「洋風空間」和「和風宅邸」兩部分，洋風空間有「表玄關（正門玄關、廣間）」「應接室（洋式接待室）」和寢室。和風宅邸則有「內玄關（側門玄關）」和兩組「座敷（日式起居室）和次間（座敷續間）」所組成。座敷與次間的隔間拉門是典型的日式拉門，上方設計有木柵窗，採用檜木板鏤空雕刻富士山景色的特殊工法，只是年代久遠，幾經維修之後如今遊客已無福欣賞。1956 年澎湖縣政府修建時，更改了局部的內部結構，寢室內的榻榻米也被拆除。