蔣經國去世後，宋美齡也離開台灣，國民黨路線搖擺不定。
尤其李登輝漸在統一立場上模糊以對，引發國民黨內不滿，集結為「非主流」勢力，公推林洋港與蔣緯國為首，希望與李登輝抗衡，角逐「總統」大位。
但最後在蔣彥士、宋楚瑜等人運作下，加上蔣孝武公開從日本返台挺李，要求蔣緯國信守蔣經國生前所提「蔣家不會再有人參選『總統』」的承諾，非主流終成泡影；但也使得國民黨內反李勢力逐漸成為柔性清黨的對象，促成新黨自國民黨分裂出走。包括蔣孝勇、蔣緯國等人雖未有明確的政治動作，卻幾乎都與李登輝關係緊張。
尤其1996年10月24日，李登輝將原保存於「總統府」內的「蔣經國辦公室」移至「大溪陵寢」，依原有陳設佈置「蔣經國紀念室」，供民眾參觀，加上他違反與宋美齡的協議，將關乎蔣介石畢生重要記錄的大溪檔案對學者公開，更引發了蔣孝勇的不悅。也就在此時，爆發了暗潮洶湧的移靈風波。