蔣介石去世幾十年，棺木放置在大理石靈柩中根本沒打開過，沒人知道是什麼狀況，也並無每年開棺防腐的說法。但基於民進黨氣焰越來越高，李登輝「統獨」路線搖擺不定，加上「兩蔣」第三代紛紛凋零，不少人質疑「兩蔣」遲不下葬對風水有礙。
長此以往，蔣家後人將不得安寧。是以蔣孝勇與蔣緯國終於在1996年再度提出移靈大陸安葬的構想。
相關消息曝光後，立刻成了敏感的政治議題，事實上，不少國民黨舊臣都擔憂，一旦民進黨執政，「兩蔣陵寢」將成為報復清算鬥爭對象，更可能被人拆陵鞭屍，不如及早遷回大陸。
只是沒想到這個燙手山芋影響實在太大，各方應變不及，不少人士更擔心此時「兩蔣」遷葬等於割斷了聯繫兩岸的重要臍帶，反而不利兩岸關係發展。因此不但李登輝積極運作，發動國民黨全體力量留人，強調「兩蔣」移靈茲事體大，是國民黨大事，不可輕率決定，大陸方面也有不同看法。
時任國台辦主任的唐樹備就發表公開談話，表示歡迎「兩蔣」靈柩遷回大陸安葬，但時間應留待到兩岸統一之後。唐樹備當時也指出，「兩蔣」墓地選址不應該在南京鍾山，而是包括浙江奉化溪口、廬山等在內的其他地方。
在幾經磋商後，加上蔣孝勇與蔣緯國之間也有不同看法，蔣緯國才收回成命，讓「兩蔣」移靈問題暫時拖了下來，不久後，蔣孝勇與蔣緯國也先後辭世。2000年陳水扁當選台灣地區領導人，使得移靈問題邁入新的階段。