在前面提到的「妖書案」「巫蠱案」「梃擊案」「紅丸案」發生時，魏忠賢還是個微末角色，當時在舞台中心的，是沈一貫、葉向高、方從哲這樣的當朝首輔。大人物多的是，排一百名下來，也輪不到他。
但是三大案的最後一案「移宮案」爆發時，原東宮膳食官魏忠賢的名字（當時還叫李進忠），就開始出現在有關史籍上了。雖然仍是小角色，但一度在本案中的作用甚大。
移宮案的主角是李選侍。在泰昌帝死後，為了給自己爭權、爭名分，她幾乎是獨自一人與廷臣展開了儲君爭奪戰。這一案的核心，就是李選侍以手中的朱由校為籌碼，不肯搬出皇帝住的乾清宮，「偃然以母后自處」（《蓮編》），試圖以此達到實際上的垂簾聽政。
她這麼幹，顯然超越禮法，大明沒有這個先例。前朝有這樣的事情，可是後果有時很難預料。廷臣怎麼能容忍？就紛紛拿了禮法這面旗幟去反對。當然，今天不乏有新一代史家認為這「姑娘」也頗值得同情。因為她不這麼幹，就有可能被打入冷宮，永遠離開權力中心，無異於殭屍。一個只當了一個月皇帝老婆的女人，就要從無限風光墮入長溝冷月之中，其情可憫。爭一爭好處，也不為怪。
當時廷臣方面，有劉一璟、周嘉謨、楊漣、左光斗等一干死硬的衛道者，勇與謀兼而有之，再加上內廷有王安與之呼應，勢力甚為了得。
李選侍當時雖然把儲君由校抓在手，可是面臨的壓力之大，幾乎不是她一個婦人能承受的。她除了內廷有幾個太監可供驅策之外，無人可給予支持。在幾次爭奪中，她又只顧耍蠻，屢屢失誤，錯失了不少良機。看起來好像氣勢很壯，實際上內心大概惶恐得很。
魏忠賢就是在此時，成為李選侍的重要智囊的。他不僅受命出面奔走，而且在關鍵時刻還能為選侍指點迷津。他出的招子，往往非常老辣，曾在不利之中為李選侍扳回了幾分。
魏忠賢為何要支持李選侍？這個問題，不應繞開不談。泰昌帝生前，李選侍有所依恃，權勢既顯赫，政治發展空間也很大。那個時候甘願為她奔走，可說是利益驅動。可是現在情況已經逆轉，新皇帝就要即位，李選侍既不是儲君的生母，又不是儲君的嫡母（常洛的太子妃早已死了），等於什麼名份也沒有。僅僅想以先帝遺孀的身份在未來政治格局中繼續發威，可能性非常小。
她身邊的一夥內侍，受她的指使，拚命阻攔廷臣搶回儲君，大多是出於習慣。主子一時還沒倒，權力幻覺仍在，再加上太監集團天然對外廷的敵視，大伙還想不到那麼多，都在死力捍衛李選侍。
可是魏忠賢不同，他是能夠看得清大局的，知道外廷不好對付，也知道李選侍是在做困獸之鬥。他之不退縮，又是他性格中的「膽氣」使然——看到一個女人可憐而出手相助。
這是一個性格相當複雜的人物。當然，也不能說他很有原則，比如，他忠心耿耿伺候了王才人多時，王才人無端被李選侍毆斃，他似乎並無義憤，轉而投入李選侍名下。對比之下，王安就很不同。王安正是因為此事，而對李選侍恨之入骨，遂支持廷臣堅決阻遏李選侍的圖謀。
可是他有時又能流露出若干同情心，很難用利益去解釋。過去他對小皇孫、對王才人，現在他對焦頭爛額的李選侍，都是如此。史家在評價他的時候，一般都強調他勾結某人、進窺中樞，而對他同情弱者這一面，因不能給出合理解釋，所以往往不提。
下面，我們就來看他在移宮案中出的幾次鏡頭。
泰昌元年（明熹宗即位後，把萬曆四十八年八月之後的幾個月改年號為泰昌元年，以紀念短命父皇。即1620年）九月初一凌晨，泰昌帝崩。李選侍攬權的第一個動作，是要求通政使司（皇帝秘書處）將每日奏章先交她閱過，再交嗣君看，這實際已經是在垂簾聽政了。這個要求，就是讓魏忠賢出來傳的話（許熙重《憲章外史彙編》）。此後儘管由校很快就被廷臣們搶走了，但這個程序卻一直被執行著，直到李選侍被迫搬家為止。
初一早上，大臣們聞知噩耗，兵科給事中楊漣便與吏部尚書周嘉謨商議：「天子寧可托婦人？」建議在進乾清宮哭臨（瞻仰遺容）的時候，把嗣君搶過來。眾大臣認為可行，於是在楊漣帶領下，突破了由宦官持梃組成的防線，闖入宮中，但是卻找不到如今身份已是皇長子的朱由校。原來，是李選侍把小傢伙藏在了暖閣裡。
首輔方從哲不是個堅定的人，他提議，可以等李選侍主動移宮以後再說。
楊漣卻毫不通融，一句話就給頂了回去：「選侍無僭居乾清之理！」（《先撥志始》）楊漣此前曾上疏抨擊萬曆的遺孀鄭貴妃，很為泰昌帝看重，將他列為了顧命諸臣之一。因此在朝中威望極高，在權力出現真空的這幾天，他的意見往往能左右大局。
隨後，楊漣便叫人把魏忠賢傳到殿上，嚴厲斥責，跟他講清了藏匿新天子的罪過。
在王安的說服下，李選侍同意讓由校出來見群臣，履行一個擁戴新天子的手續。可是，她剛一鬆手，就反悔了，急忙又拉住由校的衣襟不放。王安哪裡容得她變卦，搶過由校就跑。出了暖閣，群臣一見新天子終於露面，立刻伏地山呼「萬歲」。而後，由王安開路，劉一璟抓住由校左手，英國公張惟賢抓住右手，把小傢伙扶上了御輦。慌忙中等不及轎夫了，就由大臣們自己抬起轎子就跑，直奔文華殿。
這一路，堪稱驚心之途！不斷有宦官從乾清宮裡追出來，有的大喊：「拉少主何往？主年少畏人（主子年紀小怕外人啊）！」有的上去就拉住由校的衣服。這裡面。出力最甚的就是魏忠賢。
可以想見當時各方的狼狽。由校不過是個16歲的孩子，見到如此多的大臣和宦官在身邊呼喝奔跑，他亦是驚訝不止，面露懼色。楊漣見不是事，連忙喝斥魏忠賢等：「殿下群臣之主！四海九州莫非臣子，復畏何人！」
一直追到文華殿前，此處有聽命於廷臣的錦衣衛戒備森嚴，宦官們才悵然而歸。那時候的小由校腦子還清醒，分得出好壞，對王安說：「伴伴，今日安往？得髯閣下伴我！」——他只相信大鬍子閣臣劉一璟。
這次搶天子事件，是魏忠賢在史籍中露面的重要一幕。
搶人失敗，也許是天意。就在李選侍絕望之時，魏忠賢又給她連出了幾個主意。
九月初一這天上午，群臣把由校搶回，倉促中冊立了東宮。下一步，按楊漣的意見，待九月初九日正式登極。新太子在此期間，暫時安頓在慈慶宮（太子宮）。下午，李選侍又有了一個反手的機會：因泰昌帝要在乾清宮入殮，按禮，太子必須到場。
魏忠賢立刻向李選侍獻計：這次一定要把嗣君扣在手中。從後來的事態發展看，這是勝敗在此一舉的關鍵決策。可惜，李選侍臨陣慌亂，竟然又沒能控制住太子。
一般人認為，到此，事已不可為。李選侍是無計可施了。可是魏忠賢緊接著又建言：選侍娘娘此時應該佔據乾清宮不動。乾清宮是帝權象徵，佔住了這裡，太子即使登了位，也無法行使帝權，他只有乖乖回來。
李選侍認為此計甚好，立刻採納。她還派宮眷王春花等去慈慶宮，監視由校，不許王才人的舊日下屬與由校接近。這個舉措，就是要給由校造成一個印象：現在，我就是你的媽，還是回來吧。
可是，朱由校對李選侍沒有好感，此刻他又是在王安監護下，因此回去是不可能的。兩邊就這麼僵住。
李選侍賴在了乾清宮不走，這成了個嚴重事件。實際上嚴格來說，「移宮案」就是因這個事而引發和命名的。明史上之所以有這個移宮案，始作踴者，乃魏忠賢也。
到了九月初二，群臣怕夜長夢多，周嘉謨、楊漣、還有更為激進的御史左光斗等紛紛具疏，要求攆走李選侍。其中以左光斗的言辭最為激烈，其疏云：「及今不早決斷，將借撫養之名，行專制之實，武氏之禍，再見於今，將來有不忍言者！」（《明史·左光斗傳》）
何為「武氏之禍」？就是武則天當國、改了天下的名號。左光斗這是把事情的危害說到了極致，頓時引起朝野震驚！
李選侍看見這個奏疏，大怒，尤其厭惡疏中的「武氏」之語。魏忠賢立即建議，派人宣召左光斗入宮，讓他說清楚。暗地裡，準備就在乾清宮把左光斗害死，以儆外廷。
可是這時候李選侍根本召不動左光斗。魏忠賢便又支招，建議李選侍以「母子同宮」為由，不斷派人去慈慶宮好言好語，務求把太子哄回來。魏忠賢也為此親自跑了幾趟。
王安知道這個企圖後，大為氣憤，向外廷通報了這一情況。楊漣最怕這時候出岔子，便連日窮思竭慮，在紫禁城內外奔走，擋住李選侍派往太子那裡的說客。
兩邊在角力，太子由校則穩坐在慈慶宮。他聽說左大人有一疏，便很感興趣，派人去取了來。閱後，覺得很不錯，就下令叫李選侍「速擇日移宮」。——李選侍氣極，不但自己的號令不行，反倒要聽昔日的被監護人發號施令了。
這天，在宮門外，楊漣恰好遇見魏忠賢，便問：「移宮何日？」
魏忠賢擺手道：「莫說，李娘娘太惱，正欲究左御史『武氏之說』呢！」
楊漣為了嚇住這個狡詐且愚的人，便故作驚詫：「誤矣，幸虧遇到我。常言道：『吃飯莫忤大頭。』選侍要是好好移宮的話，將來封號仍在。且嗣皇已經成年了，他就算是不能把選侍怎麼樣，你們這些當下屬的，就不怕嗎？」（《三朝野紀》）
魏忠賢那幾日，也是在極度亢奮中，但聽了楊漣的這警告，心中有所震動，默然而退。
——據說，他自此冷靜下來，決定放棄對李選侍的支持，另謀他途。
角鬥也馬上就會有結果了。太子由校在周嘉謨的奏疏上明確批道，九月六日登極。
此後的幾天，對李選侍來說，形勢急轉直下。
李選侍當時應對的策略有二，一是放出風說，楊漣、左光斗都將被逮捕。這原本不過是恐嚇，但反而激怒了廷臣一方。二是製造延緩移宮的輿論，寄希望於首輔方從哲能從中援手。可是方從哲是個老猾官僚，哪裡肯背這個惡名？他迫於輿情，反而表態支持移宮。
到初五日，群臣見李選侍仍未有挪窩的意思，而明日就是登極之日，屆時新皇帝如果入住乾清宮，就會重回魔掌；如果不進乾清宮，那又成何體統？
這日一早，楊漣與眾大臣齊集在慈慶宮外商量對策。楊漣態度強硬，力主天子不可迴避一個宮人，他說：「即使兩宮聖母在，夫死亦應從子。選侍是何人？敢藐視天子如此！」
當時，從乾清宮過來探聽消息的宦官穿梭不止，都紛紛為選侍說情：「為何不念先皇舊寵？如此逼迫？」
楊漣被這些傢伙激怒，高聲斥道：「你輩豈是吃李家飯的麼？能殺我則罷，否則，今日不移，死不去！」（《明史·楊漣傳》）
大臣劉一璟、周嘉謨也當場力挺楊漣。眾人隨楊漣一起闖入宮中，詞色俱厲，高呼「移宮」，喊聲響徹大內！連深宮中的太子由校也被驚動了。
這就是著名的「闖宮」事件，實際是廷臣忍無可忍之下的一次示威。面對群臣情緒的爆發，李選侍惶恐不已，計無所出。王安隨後又進入乾清宮，對李選侍進行了一番恐嚇。
據說，魏忠賢在前幾天，就已勸告李選侍還是走了為好。李選侍陷入困境後，她身邊的宦官都忿忿不平，卻拿不出個主意來，惟有魏忠賢沉著如常。他一方面指責劉一璟、楊漣吃著皇家的俸祿，卻辜負皇恩；另一方面，勸李選侍若迫不得已要移宮的話，須將宮內寶物一同移走。因為這些東西都是先帝喜愛之物，現在則天經地義歸選侍所有。
魏忠賢還說，為避外廷耳目，移寶必須秘密進行，且需要一段時間一點點來。對外可稱移宮需要做準備，把時間拖得越長越好。
李選侍同意了這一建議，將此事委託給魏忠賢去辦。同時命她的心腹劉朝、田詔、王永福、劉遜、盧國相、姚進忠等從旁協助。
魏忠賢這一招，並不完全是為李選侍打算。他看準了移宮是勢所必然，死抗是毫無意義的。若能說動李選侍移走宮中珍寶，那麼他便可從中大大撈一筆。小人要想撈好處，總會鼓動上級「幹事」，不幹事，也就沒有撈財的機會。
李選侍志大才疏，左右又無真正的幹才，魏忠賢一撤步，她就完全沒有了抵抗能力。初五這天，在內外夾攻之下，這個倔強女人牙一咬，認輸了，不等內侍幫忙，就賭氣似地自己抱了女兒皇八妹，一面流淚，一面徒步走到噦鸞宮去了（宮妃的養老處）。
「移宮案」大幕就此拉下，然而，仍有餘波未盡。前幾日魏忠賢策劃和指揮的深夜盜寶，因行動不密，被宮中警衛發覺，惹了大麻煩。
據說，魏忠賢和李選侍的心腹內侍劉遜、劉朝、田詔等人，見李選侍倉促移宮，便樹倒猢猻散、誰也顧不得主子了，把李選侍的首飾衣服劫掠一空，又趁機盜竊內府財寶。有人因為太貪心了，衣服裡裝得太多，路過乾清門時一個跟斗絆倒，被門衛發現。可巧，在這批人裡，還有一個叫「李進忠」的，與當時的魏忠賢同名。
這是移宮案中的一個附案——「諸閹盜寶案」。
新即位的朱由校得報大怒，吩咐王安追究，最後是將一干人都抓起來交到法司去了。惟獨魏忠賢脫逃，他見勢不好，躲到了小哥們兒魏朝那裡。
抓起來的那一批人，在法司裡使了錢，倒還沒受太大苦，他們異口同聲說魏忠賢是主謀。據此，首輔方從哲等人上奏，要求將魏忠賢正法。
大禍臨頭了，如何走得脫？站錯隊的苦果，難嚥啊！我們且看他怎麼辦？
魏忠賢先是痛哭流涕，表示追悔莫及，求魏朝哥們兒趕緊到王安那裡說情。
魏朝此時還識不破他這「哥哥」的陰險嘴臉，立馬行動。虧得魏朝在宮裡資歷長，腦袋還靈活，編了一套瞎話，說參與盜寶的是李選侍名下的另一個「李進忠」，不是此「李進忠」。王安本就生性疏闊，視魏朝為心腹，這話也就把他蒙過去了。加之前一段時間魏忠賢常給王安送人參，好印象還沒消失，王安也就高抬了一次手。
魏忠賢就是這樣，躲過了一劫。但饒是如此，他的情況也很不妙。
他在移宮案中的死硬態度，給新皇帝朱由校和廷臣都留下極惡劣的印象。他在「盜寶案」中的罪責，也隨時可能被重新提起。
九月初六日，太子朱由校如期即皇帝位，改明年為天啟元年，是為熹宗。後人又稱他天啟皇帝。這位新皇帝堂而皇之回到乾清宮後，「宮禁肅然，內外寧謐」，亂像一掃而空。政局清明，這對魏忠賢來說，本來就不是好事。而這位天啟帝，也沒忘了幾天前蹦得很歡的魏忠賢，在上諭裡起碼有三次提到這個「李進忠」。分別提到了：他為李選侍傳話說奏章要選侍看過才給嗣君看，先帝賓天日受選侍之命「牽朕衣」，以及最要命的「盜庫首犯」一事。
更何況，在朝中還有一批日後被魏忠賢稱為「東林黨」的直臣，各個佔據要津。
這麼看來，魏忠賢的上進之路，等於完全堵死了。移宮案，是魏忠賢第一次登上政治舞台演出，不過，這一腳，登上的卻是賊船。上去容易，下來難啊！