袁世凱死後，北方連形式上的統馭，都失掉了。而南方的新勢力，又未能完成。就釀成復辟之役，和護法之戰。
當民國六年之初，歐洲戰事，德、奧方面，漸已陷入困境。德國乃於二月初，宣佈無限制潛艇戰爭。我國提出抗議，無效，即提議對德絕交。參眾兩院，先後通過。於十四日宣佈，因進而謀對德宣戰。於是國務總理段祺瑞，召集各省、區督軍、都統，在京開軍事會議。注924於四月二十五日開會。一致主張對德宣戰。五月一日，通過國務會議。提出於眾議院。七日，眾議院開委員會籌議。有自稱公民團的，包圍議院，要求必須通過。旋外交、司法、農商、海軍四總長辭職。十九日，眾議院決議：「閣員零落不全，宣戰案應俟內閣改組後再議。」是晚，各督軍、都統，分呈總統和國務總理，反對國會所通過的憲法。說「如不能改正，即請解散，另行組織」。旋即先後出京赴徐州。二十三日，黎總統免國務總理段祺瑞職，以外交總長伍廷芳代理。二十九日，安徽宣告和中央脫離關係。於是奉天、陝西、河南、浙江、山東、黑龍江、直隸、福建、山西，紛紛繼起。並在天津設立軍務總參謀處。通電說：「出師各省，意在另訂根本大法，設立臨時政府，臨時議會。」六月一日，黎總統令：「安徽督軍張勳來京，共商國是。」張勳帶定武軍五千，於八日到天津。要求黎總統解散國會。十二日，伍廷芳辭職，國會解散。十四日，張勳入京。
七月一日，張勳擁廢帝溥儀在京復辟。黎總統避入日本使館，電請馮副總統代行職務。以段祺瑞為國務總理。四日，馮、段通電出師討賊，段祺瑞在馬廠誓師。以段芝貴、曹錕為司令，分東西兩路進討。十二日，我師復京城。注925
京師既復，黎總統通電辭職。馮代總統於八月一日入京。十四日，佈告對德宣戰。
當國會解散後，廣東、廣西，即宣告軍民政務，暫行自主。重大政務，逕行秉承元首，不受非法內閣干涉。復辟之後，定後，有人主張：「民國業經中斷，可仿初建時之例，召集臨時參議院。」於是海軍第一艦隊，開赴廣東。雲南亦宣言擁護約法。八月二十五日，國會開非常會議於廣州。議決《軍政府組織大綱》：在臨時約法未恢復以前，以大元帥任行政權，對外代表中華民國。選舉孫中山為元帥。注926
此時兩廣、雲、貴，完全為護法省份。四川、福建、湖南、湖北、陝西，也有一部分獨立的。南北相持於湖南。六年十一月，南軍攻入長沙、岳州。七年三月，復為北軍所取。南方由兩院聯合會，修改《軍政府組織大綱》：「以政務總裁，組織政務會議，各部長都稱政務員，由政務員組織政務院；以政務院贊襄總裁會議，行使軍政府的行政權。」注927旋選出孫中山等七人為總裁。注928於六月初五日，宣告成立。推岑春煊為主席。國會於十二日在廣州開正式會，並續開憲法會議。北方則召集參議院，修改《國會組織法》和《兩院議員選舉法》，據以選舉、召集。八月十二日，選舉徐世昌為大總統。於十月十日就職。南方不承認。由兩院聯合會委託軍政府，代行國務院職權，以攝行大總統職務。
徐世昌就職後，通電南方，停戰議和。八年二月六日，南北各派代表，在上海開議，至五月十日而決裂。九年四五月間，北方駐紮衡陽的第三師長吳佩孚，撤防北上。七月間，在近畿和定國軍衝突。定國軍敗。於是裁督辦邊防事務處，解散安福俱樂部。注929是為皖直之戰。第三師撤防之後，南軍即佔領湖南。此時南北兩方，均撤換議和總代表。而國會議員，已先於四月間離粵。通電：「政務會議，不足法定人數。所有違法行為，當然不生效力。」七月十日，國會在雲南開會。撤岑春煊總裁之職，代以劉顯世。八月十七日，議決國會，軍政府移設重慶。十月十四日，又宣言另覓地點。是時陳炯明以駐紮漳、泉的粵軍回粵。十月二十四日，岑春煊等通電解除軍政府職務。二十六日，廣東都督莫榮新，亦宣佈取消自主。三十日，徐世昌據之，下令接收。並通令依元年《國會組織法》暨《兩院議員選舉法》籌辦選舉。是為「舊法新選」。孫中山等通電否認。回粵再開政務會議。十年一月十二日，國會再在廣州開會。四月七日，議決《中華民國政府組織大綱》。選孫中山為大總統，於五月五日就職，軍政府即於是日撤消。中山宣言：「倘徐世昌捨棄非法總統，自己亦願同時下野。」
此時北方曹錕為直魯豫巡閱使，駐保定。吳佩孚為副使，駐洛陽。王占元為兩湖巡閱使，駐武昌。張作霖為東三省巡閱使，兼蒙疆經略使，節制熱、察、綏三區，駐瀋陽。是年，五月，以閻相文為陝西督軍。命十六混成旅馮玉祥等入陝。八月，相文暴卒，以玉祥署理。七月末，在湘鄂籍軍官，組織湖北自治軍；湖南組織援鄂軍，攻入湖北。北政府免王占元，以蕭耀南為湖北督軍，吳佩孚為兩湖巡閱使。吳佩孚陷岳州，和湖南定約休戰。川軍入宜昌，亦被吳佩孚回軍擊退。十二月，吳佩孚電攻內閣撥借日款贖膠濟路，及發行九千六百萬元公債之事。注930奉天亦通電，「以武力促進統一」。十一年，四五月間，直、奉兩軍，在近畿衝突。奉軍敗退出關。河南督軍趙倜（ti）起兵，馮玉祥出兵，把他打敗。於是以馮玉祥為河南督軍。免張作霖之職。六月四日，東三省省議會舉張作霖為聯省自治保安總司令，吉、黑兩督軍為副司令。十月三十日，以馮玉祥為陸軍檢閱使。移駐南苑。
孫中山就職後，以陳炯明為陸軍總長，兼粵軍總司令。是年六月至九月間，陳炯明平定廣西。八月十日，國會通過北伐請願案。孫中山在桂林，籌備北伐。十一年，四月，中山將大本營移設韶關。陳炯明辭職，走惠州。中山命其辦理兩廣軍務，肅清土匪。五月，北伐軍分三路入江西。六月二日，徐世昌辭職。曹錕等十五省督軍電請黎元洪復位。元洪復電說：
諸公所以推元洪者，謂其能統一也，毋亦癥結固別有在乎？癥結惟何，督軍制之召亂而已。督軍諸公，如果力求統一，即請俯聽芻言，立釋兵柄。上至巡閱，下至護軍，皆刻日解職，待元洪於都門之下，共籌國是。微特變形易貌之總司令，不能存留；即欲劃分軍區，擴充疆域，變形易貌之巡閱使，亦當杜絕。
旋以各督軍、巡閱使，先後來電，均表贊同，於十一日先行入都，十三日，撤消六年六月十二日解散國會之令。國會於八月一日開會。宣言系繼六年第二期常會。而浙督盧永祥又通電說河間代理期滿，即系黃陂（pi）法定任期終了。注931廣州國會，亦通電否認。孫中山則宣言：
直軍諸將，應將所部半數，由政府改為工兵。其餘留待與全國軍隊，同時以次改編。如能履行此項條件，本大總統當立飭全國罷兵。若惟知假借名義，以塗飾耳目，本大總統深念以前禍亂，由於姑息養奸，決為國民一掃凶殘，務使護法戡亂之主張，完全貫徹。
這時候，在廣西的粵軍，先後返粵。六月十五日，圍攻總統府。聲言要求孫總統實踐與徐同退的宣言，孫中山避居軍艦。旋由香港赴上海。陳炯明復出任粵軍總司令。北伐軍回攻，不克。粵軍退入福建，滇軍退入廣西。十月，徐樹錚在延平設建國軍政制置府。通電擁戴段祺瑞、孫中山為領袖人物。粵軍退福建的，合駐延平的王永泉旅，攻入福州。徐樹錚旋出走。北政府命長江上游總司令孫傳芳入福建。是歲歲杪（miǎo），在廣西的滇、桂軍聲討陳炯明。廣東軍隊，亦有響應的。陳炯明再走惠州。十二年，二月，中山返粵，以大元帥名義，主持軍務。
護法的始末，大略如此，至國民政府成立，而後風雲一變。
【註釋】
注924 革命軍興，各省主持軍務的，均稱都督。袁世凱時，改為將軍。護國軍興，獨立省份，復稱都督。黎元洪繼任後，將軍、都督，均改稱督軍。
注925 張勳走入荷蘭使館。清帝仍居宮中。至十三年，馮玉祥軍隊回京，乃於十一月五日，勒令出宮。並修改《優待條件》，取消皇帝尊號。
注926 元帥二人。選唐繼堯、陸榮廷為之。軍政府設外交、內政、財政、陸軍、海軍、交通六部。
注927 若執行約法上大總統的職權，則以「代理國務院攝行大總統職務的資格」行之。
注928 中山外為唐紹儀、唐繼堯、伍廷芳、林葆懌（yi）、陸榮廷、岑春煊。
注929 邊防軍即參戰軍所改，臨時又改為定國軍。參看下章。
注930 時正值華盛頓會議開會，山東問題在會外解決之際，參看下章。
注931 馮國璋，河間人。黎元洪，黃陂人。